RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 OR4C3Q8NH37 302 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OR10A5Q9H207 317 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 MMP25Q9NPA2 562 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 KIAA1456Q9P272 454 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ADPRHP54922 357 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HOGA1Q86XE5 327 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 EMC6Q9BV81 110 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.78□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 KIR2DS3Q14952 304 aa14.78□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.78□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 TMEM100Q9NV29 134 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 NAGKQ9UJ70 344 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 GPR132Q9UNW8 380 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.77□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 FCGR3AP08637 254 aa14.77□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 METAP1P53582 386 aa14.77□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.77□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.77□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.77□□□□□ -0.05
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF205O95201 554 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 AGBL4Q5VU57 503 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 IL23AQ9NPF7 189 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 A6NNC1 897 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 VSIG8P0DPA2 414 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 IL13RA2Q14627 380 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PCK2Q16822 640 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ERGIC1Q969X5 290 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 B4DGG1 531 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 UTS2O95399 124 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 DBHP09172 617 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 KITLGP21583 273 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 GLIPR1P48060 266 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF90Q03938 601 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 TOX2Q96NM4 488 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 Q9N2K0 584 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 C9JQL5 133 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 Q6ZNB5 142 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PRSS50Q9UI38 385 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 EFNA3P52797 238 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 AMELYQ99218 206 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 MPZL1O95297 269 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 BIDP55957 195 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CCNOP22674 350 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PPP1CBP62140 327 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 BCORP1Q8N888 145 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 SOX7Q9BT81 388 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.75□□□□□ -0.05
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF708P17019 499 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ERVFC1-1P60608 527 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 FAM78BQ5VT40 261 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 LEMD1Q68G75 181 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CARFQ8N187 725 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 IL2RAP01589 272 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 IGHV2-5P01817 119 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 FAM157CP0CG43 387 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 S100A7P31151 101 aa14.75□□□□□ -0.05
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