RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320081.9

CLIP4-201, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLIP4, Length 4,293 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4-201ENST00000320081 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.61□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.61□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.61□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 LYZL6O75951 148 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 CD37P11049 281 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 ZNF266Q14584 549 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 MSMO1Q15800 293 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 CLLU1Q5K131 121 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 SCN5AQ14524 2016 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 VSIG8P0DPA2 414 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 GLULP15104 373 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 CSF2RBP32927 897 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 SCMH1Q96GD3 660 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 SARGQ9BW04 601 aa14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 H7C1Q1 480 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 IL5P05113 134 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 CATR1Q13166 79 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 TRIM77I1YAP6 450 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 AQP7O14520 342 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 AADACP22760 399 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 OR6S1Q8NH40 331 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 TVP23CQ96ET8 276 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 LIPT2A6NK58 231 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 OR1C1Q15619 314 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 KMT5CQ86Y97 462 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 RHOFQ9HBH0 211 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.59□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 OR6C6A6NF89 314 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 BCL2L11O43521 198 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 CDC14BO60729 498 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 ADRA2CP18825 462 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 GALP22466 123 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 GAB4Q2WGN9 574 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 ZNF721Q8TF20 911 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-201ENST00000320081 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 JTBO76095 146 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 OR5AC1P0C628 307 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 KIR2DS4P43632 304 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 KIR2DS1Q14954 304 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 SLC25A45Q8N413 288 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 FAM24AA6NFZ4 105 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 TRIM64BA6NI03 449 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 KITLGP21583 273 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 HBG1P69891 147 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 HBG2P69892 147 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 MITD1Q8WV92 249 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 ISOC2Q96AB3 205 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 ARV1Q9H2C2 271 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 DHRS3O75911 302 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 BGLAPP02818 100 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 RAB31Q13636 194 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 ASB10Q8WXI3 467 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 MALSU1Q96EH3 234 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 SMCO4Q9NRQ5 59 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 TREM2Q9NZC2 230 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 KIF25Q9UIL4 384 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 RECKO95980 971 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-201ENST00000320081 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms