RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHA1Q9HB21 404 aa12.96□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 PROK2Q9HC23 129 aa12.96□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 VDAC3Q9Y277 283 aa12.96□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1W2PPQ1 181 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 DAPL1A0PJW8 107 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 NUDT19A8MXV4 375 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 EFSO43281 561 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 FBXO24O75426 580 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ADAP1O75689 374 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 FCGR3AP08637 254 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 GALP22466 123 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 SLC16A1P53985 500 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 HERPUD1Q15011 391 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 DCUN1D4Q92564 292 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 SNX22Q96L94 193 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ALKBH4Q9NXW9 302 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ABRACLQ9P1F3 81 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 SPEGQ15772 3267 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 UMAD1C9J7I0 102 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 XRCC3O43542 346 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 OR6A2O95222 327 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 RENP00797 406 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 TRGC1P0CF51 173 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 OR13C7P0DN81 318 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 CCL3P10147 92 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 IRF2P14316 349 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 CDK2P24941 298 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 CDKN1BP46527 198 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 RPL27P61353 136 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 GUCA2AQ02747 115 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 KCTD9Q7L273 389 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF283Q8N7M2 679 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 OR1J2Q8NGS2 313 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 LRFN3Q9BTN0 628 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 MFRPQ9BY79 579 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 OR11A1Q9GZK7 315 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 LIPT2A6NK58 231 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 CYB5BO43169 146 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 LIFP15018 202 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 MDKP21741 143 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF585AQ6P3V2 769 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 TEX38Q6PEX7 206 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF519Q8TB69 540 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 SYNPRQ8TBG9 265 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 GHSRQ92847 366 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 TIMP4Q99727 224 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 SLC25A31Q9H0C2 315 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 PCSK5Q92824 1860 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1W2PNV4 684 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF17P17021 662 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 TAS2R43P59537 309 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 CD81P60033 236 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 LINC01590Q5TEZ4 76 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 SYS1Q8N2H4 156 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF417Q8TAU3 575 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 PSMF1Q92530 271 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 NKD1Q969G9 470 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 PCNX3Q9H6A9 2034 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 HSBP1L1C9JCN9 74 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 MASP2O00187 686 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 EFNA2O43921 213 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF432O94892 652 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 MT-ND5P03915 603 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ACTA2P62736 377 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ACTG2P63267 376 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 DTX1Q86Y01 620 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 C11orf42Q8N5U0 333 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 SLC30A7Q8NEW0 376 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 OR1L6Q8NGR2 347 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 FRZBQ92765 325 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 CHST11Q9NPF2 352 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM36Q9NQ86 728 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 MPDZO75970 2070 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 CACNA1HO95180 2353 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 A6NIZ1 184 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 XKRYO14609 159 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 RAMP1O60894 148 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 GTF2F2P13984 249 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 RAP1BP61224 184 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF85Q03923 595 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 DNLZQ5SXM8 178 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 PRAMEF20Q5VT98 475 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 OR5M8Q8NGP6 311 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA3-201ENST00000317201 OR13C3Q8NGS6 347 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms