RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 CDK3Q00526 305 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM156Q8N614 296 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 GPR119Q8TDV5 335 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM239Q8WW34 195 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.51□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF28P17035 718 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 TCN2P20062 427 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 GLRA1P23415 457 aa6.51□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.51□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.51□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 GPR132Q9UNW8 380 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 RCBTB2O95199 551 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 PRKAG1P54619 331 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM225Q6GV28 225 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 MS4A10Q96PG2 267 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 RASL10BQ96S79 203 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 PRRX2Q99811 253 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 ERGIC1Q969X5 290 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 SDSLQ96GA7 329 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 PAFAH1B2P68402 229 aa6.5□□□□□ -1.37
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GTF2E1-201ENST00000283875 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 C1orf189Q5VU69 101 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 LOXL4Q96JB6 756 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 CMKLR1Q99788 373 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 VAMP8Q9BV40 100 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF2E1-201ENST00000283875 COL4A3Q01955 1670 aa6.49□□□□□ -1.37
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