RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234142.9

GREB1-201, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GREB1, Length 8,444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-201ENST00000234142 NPPBP16860 134 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 C1orf220Q5T0J3 134 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 NPEPL1Q8NDH3 523 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 Q9N2K0 584 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 ACER3Q9NUN7 267 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 OR6C3Q9NZP0 311 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 ONECUT2O95948 504 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 CD82P27701 267 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 CD81P60033 236 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 ABCA1O95477 2261 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 ZAR1LA6NP61 321 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 HMGN4O00479 90 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 FADS6Q8N9I5 356 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 OR1B1Q8NGR6 318 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 hADV38S2A0JD32 116 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 AP4M1O00189 453 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 PPIHO43447 177 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 TBC1D26Q86UD7 250 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 SMIM4Q8WVI0 70 aa10.66□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 CSF2RBP32927 897 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 CLDN18P56856 261 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 TTC32Q5I0X7 151 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 TMEM251Q8N6I4 163 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 NOXO1Q8NFA2 376 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 OR13G1Q8NGZ3 307 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 CES1P1Q9UKY3 287 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 PPIL1Q9Y3C6 166 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 AKAP11Q9UKA4 1901 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 FRG2CA6NGY1 282 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 P01737 135 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 PGA4P0DJD7 388 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 PGA5P0DJD9 388 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 CAMPP49913 170 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 GSG1Q2KHT4 349 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 OR2G2Q8NGZ5 317 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 POMT2Q9UKY4 750 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 MOB4Q9Y3A3 225 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 FAM221AA4D161 298 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 UBE2L6O14933 153 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 DNPH1O43598 174 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 MBPP02686 304 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 HIST3H3Q16695 136 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 ECM29Q5VYK3 1845 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 CDRT15L2A8MXV6 281 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 H3BP45 60 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 TAS1R1Q7RTX1 841 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 OR1F12Q8NHA8 337 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 GABRG3Q99928 467 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 A4GNTQ9UNA3 340 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 IL13RA2Q14627 380 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 PDXPQ96GD0 296 aa10.65□□□□□ -0.7
GREB1-201ENST00000234142 A0A087X0M5 115 aa10.65□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 A0A1B0GX30 115 aa10.65□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 IGHA1P01876 353 aa10.65□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 IGHA2P01877 340 aa10.65□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 PI3P19957 117 aa10.65□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 OR2T10Q8NGZ9 312 aa10.65□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 RPS4Y2Q8TD47 263 aa10.65□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 DYNLRB2Q8TF09 96 aa10.65□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 NAT8Q9UHE5 227 aa10.65□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 TMEM265A0A087WTH1 108 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 SPRY3O43610 288 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 LMX1BO60663 402 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 ID1P41134 155 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 FUT7Q11130 342 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 C19orf54Q5BKX5 351 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 TMEM211Q6ICI0 200 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 LYG1Q8N1E2 194 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 ZFP30Q9Y2G7 519 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 PIK3C2AO00443 1686 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 TAPBPO15533 448 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 ICOSLGO75144 302 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 EPXP11678 715 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 NKAIN4Q8IVV8 208 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 OR5C1Q8NGR4 320 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 EID2BQ96D98 161 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 MS4A6EQ96DS6 147 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 CA10Q9NS85 328 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 A0A0U1RQS6 177 aa10.64□□□□□ -0.71
GREB1-201ENST00000234142 MBTPS2O43462 519 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms