RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 C21orf140B9A014 251 aa22.96■■□□□ 1.27
TPI1-201ENST00000229270 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa22.96■■□□□ 1.27
TPI1-201ENST00000229270 SERPINA7P05543 415 aa22.96■■□□□ 1.27
TPI1-201ENST00000229270 SFTPDP35247 375 aa22.96■■□□□ 1.27
TPI1-201ENST00000229270 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa22.96■■□□□ 1.27
TPI1-201ENST00000229270 MMP26Q9NRE1 261 aa22.96■■□□□ 1.27
TPI1-201ENST00000229270 ASF1BQ9NVP2 202 aa22.96■■□□□ 1.27
TPI1-201ENST00000229270 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TPI1-201ENST00000229270 IL32P24001 234 aa22.95■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 P4HTMQ9NXG6 502 aa22.95■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 EDARQ9UNE0 448 aa22.95■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 A0A1W2PP11 408 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 CSTBP04080 98 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 LIFP15018 202 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 ANKRD55Q3KP44 614 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 NABP1Q96AH0 204 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 PTPRBP23467 1997 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 DHHO43323 396 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 OPN1LWP04000 364 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 SLC9A3R2Q15599 337 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 NKAPLQ5M9Q1 402 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 S100A13Q99584 98 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 DECR2Q9NUI1 292 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 EHFQ9NZC4 300 aa22.94■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 SPTBN2O15020 2390 aa22.93■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 DNPH1O43598 174 aa22.93■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 HPNP05981 417 aa22.93■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 FAM157CP0CG43 387 aa22.93■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 CHRFAM7AQ494W8 412 aa22.93■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 TMEM123Q8N131 208 aa22.93■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa22.92■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 SPTSSAQ969W0 71 aa22.92■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa22.92■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 C1orf123Q9NWV4 160 aa22.92■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 STMND1H3BQB6 276 aa22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 UBE2V2Q15819 145 aa22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 SPSB1Q96BD6 273 aa22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 SLC5A7Q9GZV3 580 aa22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 NDRG3Q9UGV2 375 aa22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 E9PLN8 166 aa22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 ADAP1O75689 374 aa22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 ANOS1P23352 680 aa22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 C1QL2Q7Z5L3 287 aa22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 ZIC3O60481 467 aa22.9■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 FCGR2AP12318 317 aa22.9■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 PJVKQ0ZLH3 352 aa22.9■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 ZNF585AQ6P3V2 769 aa22.9■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 PSMF1Q92530 271 aa22.9■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 LPAR3Q9UBY5 353 aa22.9■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 HSF4Q9ULV5 492 aa22.9■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 KNTC1P50748 2209 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 NPIPA2E9PIF3 369 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 NPIPA3F8WFD2 350 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 CBR3O75828 277 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 IFNA2P01563 188 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 ID4P47928 161 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 ACER2Q5QJU3 275 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 FAM27BQ5VT28 67 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 SULF2Q8IWU5 870 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 OR9K2Q8NGE7 335 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 SMIM8Q96KF7 97 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 OR10C1Q96KK4 312 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 Q96M66 194 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 GNRHR2Q96P88 292 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 OR5AC2Q9NZP5 309 aa22.89■■□□□ 1.26
TPI1-201ENST00000229270 FAM74A7A6NL05 159 aa22.89■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 M0R135 149 aa22.89■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 NDUFA2O43678 99 aa22.89■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 KLK2P20151 261 aa22.89■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 GLRA1P23415 457 aa22.89■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 SCRN3Q0VDG4 424 aa22.89■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 FAM74A3Q4VXF1 159 aa22.89■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 C20orf196Q8IYI0 205 aa22.89■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 ZNF799Q96GE5 643 aa22.89■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 GJE1A6NN92 205 aa22.88■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 TNFSF15O95150 251 aa22.88■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 RBMXP38159 391 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 RAB32Q13637 225 aa22.88■■□□□ 1.25
TPI1-201ENST00000229270 PHYHD1Q5SRE7 291 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.2 ms