RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	NELFA	Q9H3P2	528 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341		M0R135	149 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	DHH	O43323	396 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	NR2C1	P13056	603 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	HIST3H3	Q16695	136 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	HOGA1	Q86XE5	327 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF799	Q96GE5	643 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341		A0A0B4J2A0	478 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	HOXB5	P09067	269 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	UBB	P0CG47	229 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	PRF1	P14222	555 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	LIF	P15018	202 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	S100P	P25815	95 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	MAJIN	Q3KP22	176 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	PROK2	Q9HC23	129 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	WRB	O00258	174 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	SNAPC5	O75971	98 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	SCGN	O76038	276 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	HP	P00738	406 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	SSX2	Q16385	188 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	SSX9	Q7RTT3	188 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	FBXO17	Q96EF6	278 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	PISD	Q9UG56	409 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	BCL2L11	O43521	198 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ADH6	P28332	368 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	TSC22D1	Q15714	1073 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341		A8MXK9	166 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	OR2F2	O95006	317 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	IL2RA	P01589	272 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	FGF5	P12034	268 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	PSMB6	P28072	239 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	H3F3A	P84243	136 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ECH1	Q13011	328 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	OR2F1	Q13607	317 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	PDCD1	Q15116	288 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM230	Q96A57	120 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	CRLF2	Q9HC73	371 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	MFNG	O00587	321 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	DHRS3	O75911	302 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	HPN	P05981	417 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	FGF2	P09038	288 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	B4GALT1	P15291	398 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	RFC3	P40938	356 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	S100A10	P60903	97 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	IL11RA	Q14626	422 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF774	Q6NX45	483 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	RASL12	Q9NYN1	266 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	FAM221A	A4D161	298 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	CRH	P06850	196 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	SFTPB	P07988	381 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	GLI4	P10075	376 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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