RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 OTULINQ96BN8 352 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 YY1AP1Q9H869 796 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF702PQ9H963 129 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 LRP12Q9Y561 859 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 U3KQV3 271 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PPH5 198 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 RFPL4AA6NLU0 287 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 VGLL3A8MV65 326 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 SELENOFO60613 162 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP6V1B2P21281 511 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 PAICSP22234 425 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP2K3P46734 347 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 CAPZA1P52907 286 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 LGALS4P56470 323 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2T29Q8NH02 315 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 MMP28Q9H239 520 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 NIPAL2Q9H841 368 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 REEP1Q9H902 201 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 RASL12Q9NYN1 266 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0U1RQV5 110 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PPE2 198 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PR64 198 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PRV1 198 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5B21A6NL26 309 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BN98 237 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX3O60493 162 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 CD28P10747 220 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 CCL3L1P16619 93 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 COX7A1P24310 79 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVFRD-1P60508 538 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 C16orf89Q6UX73 402 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF561Q8N587 486 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 CD177Q8N6Q3 437 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 POC1AQ8NBT0 407 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10G2Q8NGC3 310 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 SGCDQ92629 289 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 ITFG2Q969R8 447 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 PHF21AQ96BD5 680 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 R3HDM4Q96D70 268 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4F4Q96R69 305 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM206AQ9NX38 181 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 NDE1Q9NXR1 346 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 USE1Q9NZ43 259 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 TCF19Q9Y242 345 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC1A7O00341 560 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 PRODHO43272 600 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 IGLV3-1P01715 115 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP6V1B1P15313 513 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 ALOX5APP20292 161 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 PRDX2P32119 198 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF273Q14593 569 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 PLA1AQ53H76 456 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-226ENST00000593200 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms