RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590694.5

NEDD4L-231, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 165 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZIM3	Q96PE6	472 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	SH3GL1	Q99961	368 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	EXD2	Q9NVH0	621 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	NUP50	Q9UKX7	468 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	GJE1	A6NN92	205 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	MGRN1	O60291	552 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	EPPIN	O95925	133 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	AGT	P01019	485 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	RPN2	P04844	631 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF43	P17038	809 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	BTC	P35070	178 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	NPBWR2	P48146	333 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	WNT4	P56705	351 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	XIAP	P98170	497 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	PSG7	Q13046	419 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	RCN1	Q15293	331 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	CARD17	Q5XLA6	110 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC35E1	Q96K37	410 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	CCL19	Q99731	98 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	CENPK	Q9BS16	269 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	DRC3	Q9H069	523 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	MMP26	Q9NRE1	261 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	ANK2	Q01484	3957 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	GTF3C1	Q12789	2109 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694		H0YGG7	62 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCNK1	O00180	336 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	DYNC1I1	O14576	645 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	TNFSF13	O75888	250 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	STATH	P02808	62 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	CCDC172	P0C7W6	258 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	GZMA	P12544	262 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	OPRM1	P35372	400 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	CTRL	P40313	264 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	GBE1	Q04446	702 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	TGM3	Q08188	693 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	PDK2	Q15119	407 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	RAET1L	Q5VY80	246 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	SNX20	Q7Z614	316 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR2M7	Q8NG81	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	LINC01560	Q8TB33	94 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	GPR151	Q8TDV0	419 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR2A5	Q96R48	311 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	REG4	Q9BYZ8	158 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	NANOG	Q9H9S0	305 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694		A0A0G2JN53	185 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	SMCO3	A2RU48	225 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694		A8MU10	97 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694		C9JVG2	144 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NEDD4L-231	ENST00000590694	KRT14	P02533	472 aa		3.54	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms