RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 CD3EP07766 207 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 VSIG8P0DPA2 414 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 MZT1Q08AG7 82 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM255AQ5JRV8 349 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF573Q86YE8 665 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 SAXO1Q8IYX7 474 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 C15orf40Q8WUR7 153 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL21EPA6NDL7 271 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM225BP0DP42 221 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 PITPNBP48739 271 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 GPM6AP51674 278 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 PDZK1IP1Q13113 114 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 IL18Q14116 193 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8G1Q15617 311 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 GDPD1Q8N9F7 314 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5D18Q8NGL1 313 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 PHF21AQ96BD5 680 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC32Q9BV29 185 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 DIABLOQ9NR28 239 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 IL36GQ9NZH8 169 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM210A6NLX4 147 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 PITPNAQ00169 270 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF79Q15937 498 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM76BQ5HYJ3 339 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 PYHIN1Q6K0P9 492 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL9Q9H1A3 318 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP13Q9UII6 198 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 POU2F3Q9UKI9 436 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 FZR1Q9UM11 496 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ING4Q9UNL4 249 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP23Q9Y6H3 246 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 J3QRK9 145 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 MNDAP41218 407 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 MSMPQ1L6U9 139 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB12Q6IQ22 244 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 VHLLQ6RSH7 139 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 PKIBQ9C010 78 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 SRRQ9GZT4 340 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 CTAG2O75638 210 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 UNC119Q13432 240 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM200AQ86VY9 491 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 MKXQ8IYA7 352 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF611Q8N823 705 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNK15Q9H427 330 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 C14orf119Q9NWQ9 140 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 PLSCR5A0PG75 271 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 SHISA9B4DS77 424 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 XRCC3O43542 346 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 CYB5AP00167 134 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 HAAOP46952 286 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 EFNB2P52799 333 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM59Q9BXS4 323 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG5Q9H1Y0 275 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF115Q9Y4L5 304 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 LRP5LA4QPB2 252 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 RSU1Q15404 277 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A6Q4U2R8 563 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM5Q6NVV9 412 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf87Q6PH81 154 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QL2Q7Z5L3 287 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CALHM1Q8IU99 346 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CXXC4Q9H2H0 198 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 MLNRO43193 412 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC14BO60729 498 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM4BO94953 1096 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CSTBP04080 98 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK2P24941 298 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 MPZP25189 248 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 PLA2G7Q13093 441 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM69Q5SWH9 247 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10K2Q6IF99 312 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 LRP11Q86VZ4 500 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51F2Q8NH61 342 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM46BQ96A09 425 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 POM121Q96HA1 1249 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51I2Q9H344 312 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 RHOFQ9HBH0 211 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 ICE1Q9Y2F5 2266 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRM2P08172 466 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DL3P43628 341 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 IL24Q13007 206 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 PYDC2Q56P42 97 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZR03 302 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT3Q9BQG1 590 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-206ENST00000588815 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
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