RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	MCFD2	Q8NI22	146 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	S100Z	Q8WXG8	99 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ST8SIA1	Q92185	356 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	FCGR1B	Q92637	280 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC140	Q96MF4	163 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772		Q96MT0	163 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OPALIN	Q96PE5	141 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OR2V2	Q96R30	315 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CENPO	Q9BU64	300 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OR51I1	Q9H343	314 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GHITM	Q9H3K2	345 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	RNF121	Q9H920	327 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	HMG20A	Q9NP66	347 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	IFT52	Q9Y366	437 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC30	A6NM36	301 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772		M0R1W7	72 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	FAAH	O00519	579 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OVOL1	O14753	267 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	NDUFA2	O43678	99 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PRKY	O43930	277 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ICMT	O60725	284 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	COQ9	O75208	318 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	UPK1B	O75841	260 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	KCNK2	O95069	426 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OR8U9	P0C7N5	309 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CD79A	P11912	226 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OSM	P13725	252 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	POU1F1	P28069	291 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	BMI1	P35226	326 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GDNF	P39905	211 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SERPINB10	P48595	397 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SLC9A3	P48764	834 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PPP5C	P53041	499 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	UGT2B15	P54855	530 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SLC35A1	P78382	337 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	EFNB1	P98172	346 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF91	Q05481	1191 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ICAM4	Q14773	271 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM16L	Q309B1	348 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	STEAP3	Q658P3	488 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	UBALD1	Q8TB05	177 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GPR35	Q9HC97	309 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CLN6	Q9NWW5	311 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	AHSP	Q9NZD4	102 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81

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