RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF726A6NNF4 738 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FAM166BA8MTA8 275 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 B4DGG1 531 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 E7EQ34 232 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 F8VVB4 439 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 F8VWA3 439 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 H3BTX0 84 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR7A17O14581 309 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DVL1O14640 695 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PDCD5O14737 125 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FAM189A1O60320 539 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MPDU1O75352 247 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CD160O95971 181 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MT-CO3P00414 261 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 APOC3P02656 99 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MBPP02686 304 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CTSLP07711 333 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 EPCAMP16422 314 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ABOP16442 354 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MGMTP16455 207 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ENGP17813 658 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TAC1P20366 129 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MAOAP21397 527 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 IDSP22304 550 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 USF1P22415 310 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MYL9P24844 172 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CD34P28906 385 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CHRNB4P30926 498 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PYCR1P32322 319 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RPL4P36578 427 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CDKN2BP42772 138 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GABRA2P47869 451 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 P2RY1P47900 373 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ARPP19P56211 112 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CLDN2P57739 230 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00205P59089 165 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TAS2R31P59538 309 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LILRA4P59901 499 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OSTNP61366 133 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RPL8P62917 257 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ARG2P78540 354 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RUNX1Q01196 453 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PLCXD2Q0VAA5 305 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CCNIQ14094 377 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GPR18Q14330 331 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 KIR2DS5Q14953 304 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TWIST1Q15672 202 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 C3AR1Q16581 482 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF74Q16587 644 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 UPP1Q16831 310 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 MESTQ5EB52 335 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FFAR4Q5NUL3 377 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf220Q5T0J3 134 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OTPQ5XKR4 325 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FAM90A2PQ658T7 463 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FBXW12Q6X9E4 464 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZSR3 168 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZT83 130 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CHMP1BQ7LBR1 199 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HAPLN4Q86UW8 402 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 IZUMO1Q8IYV9 350 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF567Q8N184 647 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 PARP16Q8N5Y8 322 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 C15orf54Q8N8G6 183 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 SLC38A5Q8WUX1 472 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RNF138Q8WVD3 245 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 PYCR2Q96C36 320 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GPER1Q99527 375 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
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