RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554879.5

PCNX1-209, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCNX1, Length 4,431 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-209ENST00000554879 CYC1P08574 325 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 DCTDP32321 178 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 CCR9P51686 369 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 EFNB1P98172 346 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 EPXP11678 715 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 KLK2P20151 261 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 MFAP5Q13361 173 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 LINC00303Q3SY05 128 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 ABHD3Q8WU67 409 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 AKR1C4P17516 323 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 LIMK1P53667 647 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 REG4Q9BYZ8 158 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 R4GMQ9 66 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 TMEM225BP0DP42 221 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 DOC2BQ14184 412 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 POC1BQ8TC44 478 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.65□□□□□ -0.06
PCNX1-209ENST00000554879 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 MPTX1A8MV57 137 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 TAS2R60P59551 318 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 OR2A2Q6IF42 318 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SULF2Q8IWU5 870 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 GPR84Q9NQS5 396 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 TREM2Q9NZC2 230 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 IFITM5A6NNB3 132 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 OR2M7Q8NG81 312 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 OR5H15A6NDH6 313 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 AQP7P3A6NL99 342 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 TGOLN2O43493 480 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SLC34A2O95436 690 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 DDTP30046 118 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SKA3Q8IX90 412 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 APH1AQ96BI3 265 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 VPS25Q9BRG1 176 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 OR10A2Q9H208 303 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 ROS1P08922 2347 aa14.64□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 AMY2AP04746 511 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 HTR2CP28335 458 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 RAC3P60763 192 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 RNF141Q8WVD5 230 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 TMEM131Q92545 1883 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 CPN1P15169 458 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SLC6A7Q99884 636 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 OGG1O15527 345 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SPCS3P61009 180 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 PMP22Q01453 160 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 RNF128Q8TEB7 428 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 CMTM3Q96MX0 182 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 ZNF44P15621 663 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 OR6X1Q8NH79 312 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 BCO1Q9HAY6 547 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 K7EPK0 472 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 EFNA2O43921 213 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SCGB1D2O95969 90 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 OR13C7P0DN81 318 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 HNF1AP20823 631 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 GAS1P54826 345 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 PHYHIPQ92561 330 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 KCNAB3O43448 404 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 ITGB2P05107 769 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 SFTA3P0C7M3 94 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX1-209ENST00000554879 MGMTP16455 207 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms