RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	CCDC58	Q4VC31	144 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	FAM209A	Q5JX71	171 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	KLB	Q86Z14	1044 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	TMEM100	Q9NV29	134 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	AUP1	Q9Y679	476 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	MYL12B	O14950	172 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	MLNR	O43193	412 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	RGS10	O43665	173 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	DHRS3	O75911	302 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	LALBA	P00709	142 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	MT-ND2	P03891	347 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CD55	P08174	381 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CA6	P23280	308 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CRYBB2	P43320	205 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	MAP2K3	P46734	347 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	WNT4	P56705	351 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	GABARAPL2	P60520	117 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	FAM189A2	Q15884	450 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	KRT74	Q7RTS7	529 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	COMMD2	Q86X83	199 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	RDH10	Q8IZV5	341 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CCL17	Q92583	94 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	SLC22A4	Q9H015	551 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222		V9GYS6	101 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CLDN25	C9JDP6	229 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222		H0YL77	283 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CLDN34	H7C241	214 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	OGG1	O15527	345 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	GMDS	O60547	372 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	ZFPL1	O95159	310 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CST4	P01036	141 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	TNFSF4	P23510	183 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	DOC2B	Q14184	412 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	FTMT	Q8N4E7	242 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	MND1	Q9BWT6	205 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222		A0A1B0GVI7	797 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	TMEM212	A6NML5	194 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	SYT7	O43581	403 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	HLA-DPB1	P04440	258 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	TAS2R43	P59537	309 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	ACSM1	Q08AH1	577 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CDK5R1	Q15078	307 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CS-231	ENST00000552222	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		11.49	□□□□□ -0.57

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