RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 CHEK1O14757 476 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-9P01782 118 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 GPM6AP51674 278 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ERGIC1Q969X5 290 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 RPEQ96AT9 228 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 OR4F4Q96R69 305 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 OR4S2Q8NH73 311 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 ASPDHA6ND91 283 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 OR5H1A6NKK0 313 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 FGF5P12034 268 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 SKP2Q13309 424 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 BEX5Q5H9J7 111 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 CD3DP04234 171 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 FGF7P21781 194 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ASCL1P50553 236 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 LHX4Q969G2 390 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 RASL10BQ96S79 203 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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