RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GATA3P23771 443 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GATA4P43694 442 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 WNT4P56705 351 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GABARAPL2P60520 117 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 BDH1Q02338 343 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ACSM1Q08AH1 577 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CDK5R1Q15078 307 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM42Q69YG0 159 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CCL17Q92583 94 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SGCDQ92629 289 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ERGIC1Q969X5 290 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A28Q96A46 364 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2V2Q96R30 315 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MND1Q9BWT6 205 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OPN4Q9UHM6 478 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ENPP5Q9UJA9 477 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 NUP50Q9UKX7 468 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 HHLA2Q9UM44 414 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TGP01266 2768 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 F5H5P2 479 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 IFNL4K9M1U5 179 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ZFPL1O95159 310 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 FSHBP01225 129 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 HLA-DPB1P04440 258 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CD1AP06126 327 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 FAHP16930 419 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GNALP38405 381 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC3A1Q07837 685 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PRDX4Q13162 271 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MAB21L1Q13394 359 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ODF4Q2M2E3 257 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 XAF1Q6GPH4 301 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 RDH10Q8IZV5 341 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR8S1Q8NH09 359 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 Q8TCH9 128 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PIGCQ92535 297 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ITPKCQ96DU7 683 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SMIM19Q96E16 107 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SLITRK2Q9H156 845 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GCM1Q9NP62 436 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 AUP1Q9Y679 476 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM210A6NLX4 147 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 FOXH1O75593 365 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 LALBAP00709 142 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 KNG1P01042 644 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 NRASP01111 189 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MT-ND2P03891 347 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR50Q13585 617 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 SPHARQ15513 63 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 SPRNQ5BIV9 151 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 BRICD5Q6PL45 260 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 C1QL4Q86Z23 238 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms