RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF823P16415 610 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPM6AP51674 278 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC18A1P54219 525 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EDDM3BP56851 147 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST3GAL3Q11203 375 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRDX4Q13162 271 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC36A3Q495N2 470 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CALHM1Q8IU99 346 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STPG2Q8N412 459 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MREGQ8N565 214 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF561Q8N587 486 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIGCQ92535 297 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SGK3Q96BR1 496 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPDL1Q96EA4 605 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF488Q96MN9 340 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FN3KQ9H479 309 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OPA3Q9H6K4 179 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM172BPA6NC97 362 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM210A6NLX4 147 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BIRC5O15392 142 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TK1P04183 234 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTNR1BP49286 362 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSK3AP49840 483 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMS2P11Q13670 270 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNF4GQ14541 408 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADCK1Q86TW2 530 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FUNDC1Q8IVP5 155 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DRAM1Q8N682 238 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPSB4Q96A44 273 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5B12Q96R08 314 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NMNAT3Q96T66 252 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRD7Q9NPI1 651 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPM3Q9P2X0 92 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MUC4Q99102 2169 aa7.93□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TVP23AA6NH52 213 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 J3KTA2 159 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCRL2O00421 344 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFB2O95178 105 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARSBP15848 533 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCTDP32321 178 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGDIBP52566 201 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STX1BP61266 288 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR50Q13585 617 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FHL3Q13643 280 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HES1Q14469 280 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL12Q53G59 568 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM57BQ71RH2 274 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIGD4Q8IY51 512 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q8N1Y9 231 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MNS1Q8NEH6 495 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10A6Q8NH74 314 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCUN1D4Q92564 292 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF714Q96N38 554 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAG5Q9UL15 447 aa7.92□□□□□ -1.14
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