RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530238.5

BRMS1-207, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 5

Gene BRMS1, Length 1,817 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-207ENST00000530238 PECRQ9BY49 303 aa20.32■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 PCDHB10Q9UN67 800 aa20.32■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 TOR1AO14656 332 aa20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 TAAR5O14804 337 aa20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 DHHO43323 396 aa20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 ACP1P24666 158 aa20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 CHRFAM7AQ494W8 412 aa20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 DRAM2Q6UX65 266 aa20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 NTNG2Q96CW9 530 aa20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 LYZL4Q96KX0 146 aa20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 EDARQ9UNE0 448 aa20.31■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 LIFP15018 202 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 RNF144BQ7Z419 303 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 TMEM123Q8N131 208 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 NABP1Q96AH0 204 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 SPSB1Q96BD6 273 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 EHFQ9NZC4 300 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 CD79AP11912 226 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 SPINK2P20155 84 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 PRAMEF20Q5VT98 475 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 AADACL3Q5VUY0 350 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 LCN10Q6JVE6 187 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 OR9K2Q8NGE7 335 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 DKKL1Q9UK85 242 aa20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 STMND1H3BQB6 276 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 HPNP05981 417 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 SSR4P51571 173 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 SLC9A3R2Q15599 337 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 IL34Q6ZMJ4 242 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 PAQR8Q8TEZ7 354 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 IMMP1LQ96LU5 166 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 ASF1BQ9NVP2 202 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 PRELID1Q9Y255 219 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 C9J4A7 227 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 M0R135 149 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 ABCD4O14678 606 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 DEFA5Q01523 94 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 SVBPQ8N300 66 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 POC1AQ8NBT0 407 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 OR1S2Q8NGQ3 325 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF799Q96GE5 643 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 C1orf123Q9NWV4 160 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 A0A1W2PP11 408 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 ATG12O94817 140 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 FCGR2AP12318 317 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 FOXC1Q12948 553 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 FAM27BQ5VT28 67 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 RAET1LQ5VY80 246 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 RTN4RL2Q86UN3 420 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 MMP26Q9NRE1 261 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 CYTL1Q9NRR1 136 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF391Q9UJN7 358 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 PIGLQ9Y2B2 252 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 KNTC1P50748 2209 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 TMEM218A2RU14 115 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 F5H5K5 113 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 RAC1P63000 192 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 RAB35Q15286 201 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 UBE2V2Q15819 145 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 NKAPLQ5M9Q1 402 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 C20orf196Q8IYI0 205 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 CLRN3Q8NCR9 226 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 PIGQQ9BRB3 760 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 ULBP2Q9BZM5 246 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 SH2D2AQ9NP31 389 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-207ENST00000530238 IFNA2P01563 188 aa20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-207ENST00000530238 CSTBP04080 98 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-207ENST00000530238 RPS2P15880 293 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-207ENST00000530238 SERPINA2P20848 420 aa20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-207ENST00000530238 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-207ENST00000530238 ANKRD55Q3KP44 614 aa20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-207ENST00000530238 CRIP3Q6Q6R5 217 aa20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-207ENST00000530238 PLXDC2Q6UX71 529 aa20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-207ENST00000530238 OCIAD1Q9NX40 245 aa20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-207ENST00000530238 HSF4Q9ULV5 492 aa20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-207ENST00000530238 H0YIZ8 118 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms