RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRT6CP48668 564 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC7A2P52569 658 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GUCY2DQ02846 1103 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 EGR4Q05215 589 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRC74AQ0VAA2 488 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 DYRK1AQ13627 763 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF273Q14593 569 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 NR1I3Q14994 352 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4D1Q15615 310 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNMB1Q16558 191 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 IMPG1Q17R60 797 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRSS53Q2L4Q9 553 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFB114Q30KQ6 69 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPAT3Q53EU6 434 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLHL12Q53G59 568 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPIN3Q5JUX0 258 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 LIPKQ5VXJ0 399 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR88Q6ZMY6 472 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CFAP77Q6ZQR2 320 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC35D2Q76EJ3 337 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GDPD3Q7L5L3 318 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC16A9Q7RTY1 509 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFE4Q86UQ8 179 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GLB1L2Q8IW92 636 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMYD1Q8NB12 490 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM71CQ8NEG0 241 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOXO1Q8NFA2 376 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5D16Q8NGK9 328 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4P4Q8NGL7 312 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2T10Q8NGZ9 312 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5B3Q8NH48 314 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNRF2Q8NHG8 242 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANGPTL6Q8NI99 470 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD49Q8WVL7 239 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2ACQ93077 130 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLCO4A1Q96BD0 722 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SGK3Q96BR1 496 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MOAP1Q96BY2 351 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPCDCQ96CD2 204 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SDSLQ96GA7 329 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIRREL1Q96J84 757 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MS4A10Q96PG2 267 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR7D2Q96RA2 312 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERGIC2Q96RQ1 377 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARMC7Q9H6L4 198 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALG9Q9H6U8 611 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q9H8V8 135 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP6D1Q9H9H5 199 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 POPDC3Q9HBV1 291 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADGRL4Q9HBW9 690 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLE3Q9NRF9 147 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF586Q9NXT0 402 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TXNDC16Q9P2K2 825 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBQLN2Q9UHD9 624 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENPP5Q9UJA9 477 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRDM4Q9UKN5 801 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF150Q9ULK6 438 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PYCARDQ9ULZ3 195 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 HHLA2Q9UM44 414 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR1DQ9Y2S0 133 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 hADV38S2A0JD32 116 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDHR4A6H8M9 788 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM172BPA6NC97 362 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR6C6A6NF89 314 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD300LBA8K4G0 201 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF850A8MQ14 1090 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 G3V318 75 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7N7A8 449 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 BMPR1BO00238 502 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP6V0E1O15342 81 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKR7A2O43488 359 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC2A10O95528 541 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 NUDT3O95989 172 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 HPRP00739 348 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV1-40P01703 118 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV2-23P01705 113 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1QCP02747 245 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRGV3P03979 118 aa1.34□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms