RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 CD276Q5ZPR3 534 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 RDH10Q8IZV5 341 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 CYGBQ8WWM9 190 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 AQP3Q92482 292 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ALG8Q9BVK2 526 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 C8orf4Q9NR00 106 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 FRRS1LQ9P0K9 344 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 DUX4Q9UBX2 424 aa14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 IGHA1P01876 353 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 AMY2BP19961 511 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 GLRA1P23415 457 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ACTA2P62736 377 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ACTG2P63267 376 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 RAB40BQ12829 278 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 GALEQ14376 348 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF691Q5VV52 312 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 STUMQ69YW2 141 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 FDX2Q6P4F2 183 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 PHC2Q8IXK0 858 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 FGFRL1Q8N441 504 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ST8SIA4Q92187 359 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 PELI1Q96FA3 418 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 C4orf36Q96KX1 117 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.01□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 PQLC2LA1A4F0 135 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 VENTXO95231 258 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 TFF1P04155 84 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 HTR1AP08908 422 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 HAAOP46952 286 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 KLHL22Q53GT1 634 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM244Q5VVB8 128 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 TTC23Q5W5X9 447 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF573Q86YE8 665 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 DHRSXQ8N5I4 330 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM216BQ8N7L0 139 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 CNIH3Q8TBE1 160 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC6A7Q99884 636 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF649Q9BS31 505 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 INPP5EQ9NRR6 644 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 NUP50Q9UKX7 468 aa14□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 J3QT63 122 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 NDUFB3O43676 98 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 SYNGR1O43759 233 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ISG15P05161 165 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 PPIAL4GP0DN37 164 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 FPR2P25090 351 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 TGM4P49221 684 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 CCR9P51686 369 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 IKZF1Q13422 519 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 UBE2V2Q15819 145 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF788Q6ZQV5 615 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 SYS1Q8N2H4 156 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ANGPTL6Q8NI99 470 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 NPRL2Q8WTW4 380 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 TMIGD2Q96BF3 282 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 UPRTQ96BW1 309 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF488Q96MN9 340 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 DNTTIP1Q9H147 329 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 NLKQ9UBE8 527 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF69Q9UC07 566 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC7A11Q9UPY5 501 aa13.99□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa13.98□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A0A6YYJ9 748 aa13.98□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa13.98□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 NKX6-3A6NJ46 265 aa13.98□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 OR2AT4A6NND4 320 aa13.98□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 GATBO75879 557 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
KCNQ1-205ENST00000496887 ECDO95905 644 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms