RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	DYNC1I1	O14576	645 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	NPFF	O15130	113 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	GPR37	O15354	613 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	SIGLEC5	O15389	551 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	TTR	P02766	147 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	PSG2	P11465	335 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	EPHA2	P29317	976 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	CXCR4	P61073	352 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ROM1	Q03395	351 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	TAF9	Q16594	264 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	BRICD5	Q6PL45	260 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	AQP3	Q92482	292 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	DYRK2	Q92630	601 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	GPR173	Q9NS66	373 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	KRT84	Q9NSB2	600 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A1B0GUS0	222 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ACOD1	A6NK06	481 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618		H3BSH0	61 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF254	O75437	659 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	IGLV3-1	P01715	115 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	FBP1	P09467	338 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	CAPZA1	P52907	286 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ESRRG	P62508	458 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	TNFRSF14	Q92956	283 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	TBX5	Q99593	518 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF222	Q9UK12	451 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	RNF114	Q9Y508	228 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	MEIOC	A2RUB1	952 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618		G3V2T6	193 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	SYNGR1	O43759	233 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	NRAS	P01111	189 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	SAA4	P35542	130 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	CAV3	P56539	151 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	CD177	Q8N6Q3	437 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC01006	Q8NI28	216 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM163	Q8TC26	289 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ZAR1L	A6NP61	321 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	DHRS3	O75911	302 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	APOL3	O95236	402 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	PAH	P00439	452 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ATP6V1B1	P15313	513 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	PAX6	P26367	422 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618		Q6ZSV7	163 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	ASRGL1	Q7L266	308 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	KRT74	Q7RTS7	529 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	SSX6	Q7RTT6	188 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	C17orf50	Q8WW18	174 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	CITED1	Q99966	193 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG4B-223	ENST00000493618	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		11.98	□□□□□ -0.49

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