RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 MOB3CQ70IA8 216 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 FTMTQ8N4E7 242 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 SPSB4Q96A44 273 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 SLC7A11Q9UPY5 501 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OR2AT4A6NND4 320 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZNF35P13682 527 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 NAT1P18440 290 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZNF81P51508 661 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 PTPRBP23467 1997 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 H3BUI4 141 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 SSTR2P30874 369 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ARR3P36575 388 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 CBX5P45973 191 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 DHRS2Q13268 280 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ST8SIA4Q92187 359 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 Q96M66 194 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 SLC22A5O76082 557 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 AMY2BP19961 511 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 FUT6P51993 359 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 SERPINE3A8MV23 424 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 F5H5P2 479 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 COX5BP10606 129 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ATP1B3P54709 279 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 CLN3Q13286 438 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OPN4Q9UHM6 478 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 PLP2Q04941 152 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ACTBL2Q562R1 376 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZNF175Q9Y473 711 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 IL18BPO95998 194 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 SERPINA5P05154 406 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 TPOP07202 933 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 MPGP29372 298 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ARL6IP1Q15041 203 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 TAF9Q16594 264 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 HOGA1Q86XE5 327 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 DOCK7Q96N67 2140 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 CEACAM1P13688 526 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 MALLQ13021 153 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 GPR160Q9UJ42 338 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 IGKV1D-12P01611 117 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 HTR2BP41595 481 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OR3A3P47888 321 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OR3A2P47893 321 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 PER3P56645 1201 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R1AQ13522 171 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ASCL4Q6XD76 172 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 TERB2Q8NHR7 220 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 RADILQ96JH8 1075 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 TECTBQ96PL2 329 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms