RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP8B1O43520 1251 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFS5O43920 106 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 RP2O75695 350 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A5O76082 557 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 NEFHP12036 1026 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 MT3P25713 68 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXA9P31269 272 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 TTPAP49638 278 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 GFERP55789 205 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 CRADDP78560 199 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf107Q8IVU9 208 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM251Q8N6I4 163 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5L1Q8NGL2 311 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTL9Q8TC94 416 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM45AQ8TCE6 357 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM104AQ969W3 186 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 PTX4Q96A99 478 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 CMTM5Q96DZ9 223 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 IMMP1LQ96LU5 166 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM56Q96MV1 263 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 METTL26Q96S19 204 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 PLSCR3Q9NRY6 295 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC7A10Q9NS82 523 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 IL17CQ9P0M4 197 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 FTCDNL1E5RQL4 147 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 TAAR5O14804 337 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 CA11O75493 328 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMG1O95456 288 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 DTYMKP23919 212 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 DRD3P35462 400 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 COILP38432 576 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 HAAOP46952 286 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 ERFP50548 548 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC36A2Q495M3 483 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 COQ5Q5HYK3 327 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM45BPQ6NSW5 357 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 MED27Q6P2C8 311 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 OPN5Q6U736 354 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 DRAM2Q6UX65 266 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 C12orf56Q8IXR9 622 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 PGAM4Q8N0Y7 254 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM156Q8N614 296 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF485Q8NCK3 441 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC01006Q8NI28 216 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAKDQ8WVC6 231 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 YIPF6Q96EC8 236 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 NRTNQ99748 197 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 NANOGQ9H9S0 305 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 MANBAO00462 879 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 CYTH3O43739 400 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V1G2O95670 118 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 OCM2P0CE71 109 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGP20916 626 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 GNB2P62879 340 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 BAXQ07812 192 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 PNOCQ13519 176 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 PMVKQ15126 192 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 RGS21Q2M5E4 152 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNYL1Q8N7R7 359 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 BLNKQ8WV28 456 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 DDIT4LQ96D03 193 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP170P1Q96L14 293 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.19□□□□□ -1.741e-12■■■■□ 21.1
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R13Q9NYV9 303 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP23Q9P227 1491 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 SYNGR1O43759 233 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 HPGDSO60760 199 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINB7O75635 380 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 GCLMP48507 274 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 DLX6P56179 175 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 CDK5Q00535 292 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF774Q6NX45 483 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM92BQ6ZTR7 304 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 GHSRQ92847 366 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 PGLYRP3Q96LB9 341 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 BIRC8Q96P09 236 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR22Q99680 433 aa4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms