RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 MOB1AQ9H8S9 216 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 BEX1Q9HBH7 125 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 SNTG1Q9NSN8 517 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 NLKQ9UBE8 527 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 ENPP5Q9UJA9 477 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 OR52A1Q9UKL2 312 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 IKZF2Q9UKS7 526 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 COPS3Q9UNS2 423 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 PIGLQ9Y2B2 252 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 SNX5Q9Y5X3 404 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 R4GMQ9 66 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1B0GW55 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 PRR32B1ATL7 298 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 M0R1W7 72 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 RHBDL1O75783 438 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 NDUFA7O95182 113 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 TTRP02766 147 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 HTR1FP30939 366 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 IER3P46695 156 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 GABRA2P47869 451 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 GMFBP60983 142 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 IKZF1Q13422 519 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 BLMHQ13867 455 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DGUOKQ16854 277 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 CEP78Q5JTW2 689 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 PRR31Q5SQ13 230 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 CLVS2Q5SYC1 327 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM42Q69YG0 159 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 C10orf67Q8IYJ2 551 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 FGFRL1Q8N441 504 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 Q8N7P7 452 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DYRK2Q92630 601 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 SDSLQ96GA7 329 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 GAFA1Q96PS6 74 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 CHIAQ9BZP6 476 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 ADGRL4Q9HBW9 690 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 DUX4Q9UBX2 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 MAB21L2Q9Y586 359 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 V9GYS6 101 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 A0A0U1RQK1 487 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1B0GTI1 187 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PPH5 198 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 METTL15A6NJ78 407 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 RFPL4AA6NLU0 287 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 J3QT63 122 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 CIB2O75838 187 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 SULT1C4O75897 302 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 SERPINA3P01011 423 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 KNG1P01042 644 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 KRT8P05787 483 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 FBP1P09467 338 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 PGA5P0DJD9 388 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 FAHP16930 419 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 NDUFB7P17568 137 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 MDKP21741 143 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 PRDX2P32119 198 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 ATP6V1E1P36543 226 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 UBE2E1P51965 193 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 ACSM1Q08AH1 577 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRF-210ENST00000463041 NCR3LG1Q68D85 454 aa5.98□□□□□ -1.45
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