RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF44P15621 663 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 CAV2P51636 162 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 QRFPP83859 136 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 TLE1Q04724 770 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 UCN2Q96RP3 112 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 NMES1Q9C002 83 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 SH3BGRL3Q9H299 93 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC26A1Q9H2B4 701 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 MELTFP08582 738 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 PIGPP57054 158 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 C9orf135Q5VTT2 229 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 AADACL3Q5VUY0 350 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM213BQ8TBF2 198 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF700Q9H0M5 742 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 MAGT1Q9H0U3 335 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 B3GAT1Q9P2W7 334 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 MEMO1Q9Y316 297 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 SHISA7A6NL88 538 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR37O15354 613 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 IFNA2P01563 188 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 UBE2V2Q15819 145 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 PDZD11Q5EBL8 140 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 SPIN3Q5JUX0 258 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 OR11L1Q8NGX0 322 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 UQCC2Q9BRT2 126 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PPE2 198 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF528Q3MIS6 628 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 GGNBP1Q5YKI7 109 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 LYZL2Q7Z4W2 148 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM217Q8N7C4 229 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 NOXO1Q8NFA2 376 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 SPSB2Q99619 263 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKUB1A6NFN9 424 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 TPPPO94811 219 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 AWAT1Q58HT5 328 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 NCMAPQ5T1S8 102 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC5A7Q9GZV3 580 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 WIF1Q9Y5W5 379 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 PET100P0DJ07 73 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 FPR2P25090 351 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 FABP9Q0Z7S8 132 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 RSU1Q15404 277 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 PECRQ9BY49 303 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 FGF16O43320 207 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 OR5AC1P0C628 307 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 HKR1P10072 659 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF708P17019 499 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF17P17021 662 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 NHLH2Q02577 135 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 PLXDC2Q6UX71 529 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ARRDC1Q8N5I2 433 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 DEFB126Q9BYW3 111 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 RAB18Q9NP72 206 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ALKBH4Q9NXW9 302 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 LAMA5O15230 3695 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 KNTC1P50748 2209 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF407Q9C0G0 2248 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PQD3 144 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 OR5H8P0DN80 308 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 CD79AP11912 226 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ASB13Q8WXK3 278 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 SEC11CQ9BY50 192 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 PADI1Q9ULC6 663 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 MMP24Q9Y5R2 645 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 LILRA5A6NI73 299 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 LINC00587B1AMM8 73 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 C3orf80F5H4A9 247 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 IFI6P09912 130 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 THEM4Q5T1C6 240 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 OR9K2Q8NGE7 335 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 IFT22Q9H7X7 185 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 PRSS44E7EML9 344 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 SCRG1O75711 98 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 ONECUT2O95948 504 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 LCATP04180 440 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 CCR5P51681 352 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 C1orf123Q9NWV4 160 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRJ-202ENST00000440289 DBX1A6NMT0 343 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 CDRT15L2A8MXV6 281 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 LMO7DNF2Z398 122 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 CSNK1A1P48729 337 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms