RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 SDK1Q7Z5N4 2213 aa10.45□□□□□ -0.74
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CCBE1-202ENST00000439986 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 WNT11O96014 354 aa10.45□□□□□ -0.74
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CCBE1-202ENST00000439986 CLLU1Q5K131 121 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 OR1N1Q8NGS0 311 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 OR10J5Q8NHC4 309 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 NXPE3Q969Y0 559 aa10.43□□□□□ -0.74
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CCBE1-202ENST00000439986 CD3EP07766 207 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 FABP4P15090 132 aa10.43□□□□□ -0.74
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CCBE1-202ENST00000439986 CDK5R1Q15078 307 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 GGNBP1Q5YKI7 109 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM178AQ8NBL3 297 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 SMIM4Q8WVI0 70 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 PATE1Q8WXA2 126 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 ORAI1Q96D31 301 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 BOD1Q96IK1 185 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 CTDSP1Q9GZU7 261 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 SLC52A3Q9NQ40 469 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 CACNA1CQ13936 2221 aa10.43□□□□□ -0.74
CCBE1-202ENST00000439986 AP4M1O00189 453 aa10.43□□□□□ -0.74
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