RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DGUOK	Q16854	277 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		Q8N7P7	452 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CITED1	Q99966	193 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MMP27	Q9H306	513 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF222	Q9UK12	451 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	AP4S1	Q9Y587	144 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0U1RQK1	487 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2AT4	A6NND4	320 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		M0QZ24	198 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP5H	O75947	161 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TFF1	P04155	84 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	FAH	P16930	419 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GLRA1	P23415	457 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RAG2	P55895	527 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CAV3	P56539	151 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RELB	Q01201	579 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM42	Q69YG0	159 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZSR3	168 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	AQP3	Q92482	292 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFRSF14	Q92956	283 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MED30	Q96HR3	178 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CLN6	Q9NWW5	311 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMM23	O14925	209 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFA7	O95182	113 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PSG2	P11465	335 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	EGR3	Q06889	387 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	COMMD2	Q86X83	199 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GID4	Q8IVV7	300 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CIB1	Q99828	191 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	APOL4	Q9BPW4	351 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C1RL	Q9NZP8	487 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		R4GMQ9	66 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		V9GYS6	101 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GTI1	187 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NRAS	P01111	189 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	FCGR1A	P12314	374 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	IER3	P46695	156 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTR3	P61158	418 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	BRICD5	Q6PL45	260 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MOB3C	Q70IA8	216 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DYRK2	Q92630	601 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DLGAP1	O14490	977 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV4-59	P01825	116 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GUCA2A	Q02747	115 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SSX6	Q7RTT6	188 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	POC1A	Q8NBT0	407 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SDSL	Q96GA7	329 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		14.53	□□□□□ -0.08

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