RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 DEFA6Q01524 100 aa17.18■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa17.18■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 SNAPC1Q16533 368 aa17.18■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZSV7 163 aa17.18■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA24Q86W54 205 aa17.18■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF671Q8TAW3 534 aa17.18■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 SDSLQ96GA7 329 aa17.18■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 OR8B4Q96RC9 309 aa17.18■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 RASL12Q9NYN1 266 aa17.18■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 PSG2P11465 335 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFB7P17568 137 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 TGFBR2P37173 567 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 HCCSP53701 268 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 CRISP1P54107 249 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 KLRD1Q13241 179 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 BLMHQ13867 455 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 CEP78Q5JTW2 689 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 ASPHD2Q6ICH7 369 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 FAHD1Q6P587 224 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 AQP3Q92482 292 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 PRRG3Q9BZD7 231 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 MOB1AQ9H8S9 216 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 TVP23BQ9NYZ1 205 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 MAB21L2Q9Y586 359 aa17.17■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQ09 198 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 GYG2O15488 501 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS3O75911 302 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 PAHP00439 452 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 RIDAP52758 137 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 THAP5Q7Z6K1 395 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 BEND2Q8NDZ0 799 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 OR5D13Q8NGL4 314 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 OR51E1Q8TCB6 317 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 MNTQ99583 582 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 GPR84Q9NQS5 396 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 ENPP5Q9UJA9 477 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 POMPQ9Y244 141 aa17.16■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 MEIOCA2RUB1 952 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 PRR32B1ATL7 298 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 PSMD9O00233 223 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 GSC2O15499 205 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 TFF1P04155 84 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 GABRA2P47869 451 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 DLX1P56177 255 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 ESRRGP62508 458 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 MIDNQ504T8 468 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 PLCXD3Q63HM9 321 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 COMMD2Q86X83 199 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 POC1AQ8NBT0 407 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 ZNRF1Q8ND25 227 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 COPS3Q9UNS2 423 aa17.15■□□□□ 0.34
LIMS1-208ENST00000428064 DYNC1I1O14576 645 aa17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 FAHP16930 419 aa17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM21Q3B7S5 101 aa17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM42Q69YG0 159 aa17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 HCP5Q6MZN7 132 aa17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 ACP7Q6ZNF0 438 aa17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM185AQ8NFB2 350 aa17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 PIGLQ9Y2B2 252 aa17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A31A6NKX4 558 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS7CA6NNS2 312 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 PRKYO43930 277 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 TTRP02766 147 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 DAPP51397 102 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF684Q5T5D7 378 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZSR3 168 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 MOB3CQ70IA8 216 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF573Q86YE8 665 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 PNKDQ8N490 385 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF561Q8N587 486 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 OR5K1Q8NHB7 308 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 TCF7L1Q9HCS4 588 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 IKZF2Q9UKS7 526 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 V9GYS6 101 aa17.13■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PPH5 198 aa17.12■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PRD5 423 aa17.12■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PRF3 423 aa17.12■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PRM7 423 aa17.12■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 H0YAE9 185 aa17.12■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 J3QT63 122 aa17.12■□□□□ 0.33
LIMS1-208ENST00000428064 DLGAP1O14490 977 aa17.12■□□□□ 0.33
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