RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416108.5

RBM39-208, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-208	ENST00000416108	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	MKX	Q8IYA7	352 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	ACBD4	Q8NC06	268 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	GFI1	Q99684	422 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	CST11	Q9H112	138 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	METTL9	Q9H1A3	318 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	MMP27	Q9H306	513 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	DECR2	Q9NUI1	292 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	GHRL	Q9UBU3	117 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	ETV7	Q9Y603	341 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108		A0A075B6Q4	140 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	C17orf100	A8MU93	164 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	FAM25A	B3EWG3	89 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	FAM25C	B3EWG5	89 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	FAM25G	B3EWG6	89 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108		F5H5P2	479 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108		H0YL77	283 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108		J3QT63	122 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	CLPX	O76031	633 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	KDM4B	O94953	1096 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	HTR3B	O95264	441 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	BPNT1	O95861	308 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	IGHV1-46	P01743	117 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	IRF2	P14316	349 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	ARSB	P15848	533 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	SERPINA2	P20848	420 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	THBS2	P35442	1172 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	PTGFR	P43088	359 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	CLDN12	P56749	244 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	SCAND1	P57086	179 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	TESK1	Q15569	626 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	FAM209A	Q5JX71	171 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108		Q6ZR03	302 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF611	Q8N823	705 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	PHF21A	Q96BD5	680 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	OR2V2	Q96R30	315 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	PKIB	Q9C010	78 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	IL19	Q9UHD0	177 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	SPATA2	Q9UM82	520 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-208	ENST00000416108	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	ANGPTL7	O43827	346 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	CTAG2	O75638	210 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	CFP	P27918	469 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	TALDO1	P37837	337 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	PPOX	P50336	477 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	BMX	P51813	675 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	ART1	P52961	327 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	ZP1	P60852	638 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	IL24	Q13007	206 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF154	Q13106	437 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	PXT1	Q8NFP0	134 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-208	ENST00000416108	OR51F2	Q8NH61	342 aa		7.14	□□□□□ -1.27

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