RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A1B0GX12 115 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 GOLGA8IPA6NC78 632 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 F8VZ95 297 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 GOLGA8RI6L899 631 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 M0QXV9 152 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 M0R1X1 148 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHST10O43529 356 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 NDUFS5O43920 106 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC22O60826 627 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 RCBTB2O95199 551 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 TNFAIP8O95379 198 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGHV3-11P01762 117 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 APCSP02743 223 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF688P0C7X2 276 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 PSG2P11465 335 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF823P16415 610 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 MDKP21741 143 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 GTF2H1P32780 548 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 PSMB2P49721 201 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD164Q04900 197 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 MADCAM1Q13477 382 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMUG1Q53HV7 270 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 Q6ZSR6 202 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 CRLF3Q8IUI8 442 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM9CQ8IZT9 166 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF786Q8N393 782 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR4K17Q8NGC6 315 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR4M1Q8NGD0 313 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR4K5Q8NGD3 323 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 SFXN5Q8TD22 340 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF414Q96IQ9 312 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARL5BQ96KC2 179 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR2M4Q96R27 311 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF382Q96SR6 550 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 HBEGFQ99075 208 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 RSG1Q9BU20 258 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 PARVGQ9HBI0 331 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCML1Q9UN30 329 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNX24Q9Y343 169 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 H0YJW9 148 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMLR1H3BR10 107 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 SULT1C2O00338 296 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPAG7O75391 227 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 E2F6O75461 281 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 EIF1P41567 113 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 SYCNQ0VAF6 134 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAPRE2Q15555 327 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRAM1Q15629 374 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCL15Q16663 113 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 CEACAM16Q2WEN9 425 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 C2orf83Q53S99 150 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 GUSBP11Q6P575 273 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 LINC01551Q86U37 167 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 NECAP1Q8NC96 275 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR1L1Q8NH94 360 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 HGDQ93099 445 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM159Q96B96 161 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 METTL26Q96S19 204 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABCB9Q9NP78 766 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANAPC11Q9NYG5 84 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF222Q9UK12 451 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBX21Q9UL17 535 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM223A0PJW6 202 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR5H1A6NKK0 313 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 ITGB1BP1O14713 200 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 UBDO15205 165 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGLV2-8P01709 118 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 HLA-DQA1P01909 254 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 HLA-GP17693 338 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRSS3P35030 304 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-272P-201ENST00000411028 KIR3DL2P43630 455 aa2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms