RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-208	ENST00000392449	GNG3	P63215	75 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449		Q6ZSV7	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	AQP3	Q92482	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	MED30	Q96HR3	178 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	MRO	Q9BYG7	248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	MEIOC	A2RUB1	952 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449		A6NIN4	97 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	GPR37	O15354	613 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	FBP1	P09467	338 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	PROK1	P58294	105 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	MIDN	Q504T8	468 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	APOL4	Q9BPW4	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	SYNGR1	O43759	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	TTR	P02766	147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	CAV3	P56539	151 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	GUCA2A	Q02747	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ROM1	Q03395	351 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	KRT74	Q7RTS7	529 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	TEX12	Q9BXU0	123 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	NOTCH1	P46531	2555 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	TG	P01266	2768 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	CXCR4	P61073	352 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	CD177	Q8N6Q3	437 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	RORB	Q92753	470 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	GPR173	Q9NS66	373 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	OR5B21	A6NL26	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449		H3BSH0	61 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449		M0R1W7	72 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	GSC2	O15499	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	PAH	P00439	452 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	NRAS	P01111	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	UBE2E1	P51965	193 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	CAPZA1	P52907	286 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	SSX6	Q7RTT6	188 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	KRT84	Q9NSB2	600 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449		H0YAE9	185 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF254	O75437	659 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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