RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 VSTM5A8MXK1 200 aa21.59■■□□□ 1.05
SNX15-202ENST00000377244 RBMXP38159 391 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SNX15-202ENST00000377244 PTGFRP43088 359 aa21.59■■□□□ 1.05
SNX15-202ENST00000377244 OR10K2Q6IF99 312 aa21.59■■□□□ 1.05
SNX15-202ENST00000377244 MUC15Q8N387 334 aa21.59■■□□□ 1.05
SNX15-202ENST00000377244 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SNX15-202ENST00000377244 ELMOD3Q96FG2 381 aa21.59■■□□□ 1.05
SNX15-202ENST00000377244 SLC22A4Q9H015 551 aa21.59■■□□□ 1.05
SNX15-202ENST00000377244 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa21.58■■□□□ 1.05
SNX15-202ENST00000377244 HPGDSO60760 199 aa21.58■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa21.58■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 BATF2Q8N1L9 274 aa21.58■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 ZNF611Q8N823 705 aa21.58■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 ABCB9Q9NP78 766 aa21.58■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 GRPP07492 148 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 TMEM225BP0DP42 221 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 ARSBP15848 533 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 ZNF154Q13106 437 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 C2orf76Q3KRA6 126 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 OR10K1Q8NGX5 313 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 TBC1D15Q8TC07 691 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 FBXW5Q969U6 566 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 MIXL1Q9H2W2 232 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 ABRACLQ9P1F3 81 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 M0R233 179 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 RIN1Q13671 783 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SLC25A26Q70HW3 274 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SAMD12Q8N8I0 201 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 CXXC4Q9H2H0 198 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 OR51I2Q9H344 312 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 A3GALT2U3KPV4 340 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 A0A1W2PP11 408 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 IGKV1D-12P01611 117 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 IGHV1-46P01743 117 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 COL8A1P27658 744 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 EVX1P49640 407 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 PDZK1IP1Q13113 114 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 EFNB3Q15768 340 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 ACOT12Q8WYK0 555 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 FAM46BQ96A09 425 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 ING4Q9UNL4 249 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 B9A039 149 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 C3orf80F5H4A9 247 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 HS3ST1O14792 307 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SYNGR1O43759 233 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 EFNB2P52799 333 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 MPPED2Q15777 294 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SLC22A6Q4U2R8 563 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 FBXL14Q8N1E6 418 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SPATA2Q9UM82 520 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 CALCBP10092 127 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 MADCAM1Q13477 382 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 MOGQ16653 247 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SWI5Q1ZZU3 235 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 FAM76BQ5HYJ3 339 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 MZT2AQ6P582 158 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 OR2V2Q96R30 315 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 CYSLTR2Q9NS75 346 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 UFSP2Q9NUQ7 469 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 RHBDL1O75783 438 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 VSIG8P0DPA2 414 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 UNC119Q13432 240 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 ZNF573Q86YE8 665 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SCCPDHQ8NBX0 429 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 TMEM104Q8NE00 496 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 OR51F2Q8NH61 342 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SLC25A38Q96DW6 304 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 GAL3ST1Q99999 423 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 UBTD1Q9HAC8 227 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 DYNLRB1Q9NP97 96 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 LRP5LA4QPB2 252 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 C17orf100A8MU93 164 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 CDIPTO14735 213 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SOD3P08294 240 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 ZNF826PQ6ZT77 177 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 DTX3Q8N9I9 347 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SPERTQ8NA61 448 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 ITLN1Q8WWA0 313 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 SLAMF9Q96A28 289 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 AKAP6Q13023 2319 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 FAM221AA4D161 298 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-202ENST00000377244 BPNT1O95861 308 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms