RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 EXD3Q8N9H8 876 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR2T33Q8NG76 320 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZBP1Q9H171 429 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR13Q9NZ81 148 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR6C3Q9NZP0 311 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 INSL6Q9Y581 213 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 HSD17B6O14756 317 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRSS3P35030 304 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSMB10P40306 273 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSG6Q00889 435 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF85Q03923 595 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF77Q15935 545 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 AMZ1Q400G9 498 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 NOXO1Q8NFA2 376 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM106AQ96A25 262 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 MS4A10Q96PG2 267 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 KCNK15Q9H427 330 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDH20Q9HBT6 801 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 CST4P01036 141 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADH5P11766 374 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 IL9P15248 144 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 RAB28P51157 221 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 BIDP55957 195 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRSS8Q16651 343 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 OTPQ5XKR4 325 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERGIC1Q969X5 290 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 TVP23CQ96ET8 276 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 AQP10Q96PS8 301 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP5D1E7EU14 171 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 CXCL10P02778 98 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 POU2F2P09086 479 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 P2RY2P41231 377 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDK3Q00526 305 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 GAS6Q14393 721 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 LILRA6Q6PI73 481 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 SAXO1Q8IYX7 474 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADIPOR1Q96A54 375 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 NICN1Q9BSH3 213 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBKSQ9H477 322 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 TLCD2A6NGC4 264 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 C4orf47A7E2U8 309 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 MMP9P14780 707 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRRX1P54821 245 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC35A1P78382 337 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 HYAL1Q12794 435 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 RAB32Q13637 225 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 CST9LP1Q5W188 147 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMIM19Q96E16 107 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 VAMP8Q9BV40 100 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1B0GU03 582 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms