RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 FOXF1Q12946 379 aa10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 IL34Q6ZMJ4 242 aa10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 Q6ZRG5 221 aa10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 HOGA1Q86XE5 327 aa10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 ARRDC1Q8N5I2 433 aa10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 OR8U1Q8NH10 309 aa10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 STT3BQ8TCJ2 826 aa10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 RNF133Q8WVZ7 376 aa10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 EHFQ9NZC4 300 aa10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa10.65□□□□□ -0.7
NLRC3-201ENST00000324659 A0A1W2PNR3 127 aa10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SLC31A2O15432 143 aa10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 NME2P1O60361 137 aa10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 GLI4P10075 376 aa10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 BTF3P20290 206 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 HTR5AP47898 357 aa10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 DAP3P51398 398 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PRAMEF20Q5VT98 475 aa10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FAM57BQ71RH2 274 aa10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 KCNK17Q96T54 332 aa10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF319Q9P2F9 582 aa10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa10.65□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FTCDNL1E5RQL4 147 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 TSPAN15O95858 294 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CLRN1P58418 232 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 QRFPP83859 136 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 MST1LQ2TV78 715 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 C10orf91Q5T1B1 145 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 HIST2H3AQ71DI3 136 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SHDQ96IW2 340 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ATG101Q9BSB4 218 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SMOC1Q9H4F8 434 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SVILO95425 2214 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SERPINA2P20848 420 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 RBP2P50120 134 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 MMP16P51512 607 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PRSS12P56730 875 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 GUSBP11Q6P575 273 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 LYPD6Q86Y78 171 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 OR51T1Q8NGJ9 327 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 OR1N1Q8NGS0 311 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 MISP3Q96FF7 219 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PISDQ9UG56 409 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 MMACHCQ9Y4U1 282 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 C5orf63A6NC05 138 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 A6NIZ1 184 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF878C9JN71 531 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FOLR2P14207 255 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FOSL2P15408 326 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM50BP56557 158 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 RAP1BP61224 184 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 RAP1AP62834 184 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SLC25A45Q8N413 288 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF283Q8N7M2 679 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SLC30A7Q8NEW0 376 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 OPA3Q9H6K4 179 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 METTL7AQ9H8H3 244 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 RNF122Q9H9V4 155 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 TAF9BQ9HBM6 251 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FBXO7Q9Y3I1 522 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SIT1Q9Y3P8 196 aa10.64□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FER1L5A0AVI2 2057 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SHISA7A6NL88 538 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 TSTD3H0UI37 97 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PHOX2AO14813 284 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CDC14BO60729 498 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PRH1P02810 166 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 COL6A3P12111 3177 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 HLA-GP17693 338 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF84P51523 738 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 NXPH1P58417 271 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CDCP2Q5VXM1 449 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 OR8B12Q8NGG6 310 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM234Q8WY98 164 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CDC6Q99741 560 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CRLF2Q9HC73 371 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CHST11Q9NPF2 352 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 DBX1A6NMT0 343 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SFT2D2O95562 160 aa10.63□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 IGHV2-5P01817 119 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms