RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf170A2RU37 121 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 HMSDA8MTL9 139 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 SHISA8B8ZZ34 492 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 NHSQ6T4R5 1651 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 HNF1AP20823 631 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 POM121L2Q96KW2 1035 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD1Q96SE0 405 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO34Q9NWN3 711 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 GPANK1O95872 356 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF425Q6IV72 752 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC187A0A096LP49 1063 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A1P30531 599 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CSF2RBP32927 897 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF429Q86V71 674 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 OR11G2Q8NGC1 345 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CTDSPLO15194 276 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 COX7A2P2O60397 106 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 MPC2O95563 127 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 MTCH2Q9Y6C9 303 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPB8E9PQR5 432 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CD160O95971 181 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 F2RP25116 425 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CNN1P51911 297 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 M1APQ8TC57 530 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 MCHR2Q969V1 340 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 UQCC1Q9NVA1 299 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 SHISA7A6NL88 538 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF17P17021 662 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 PLPP3O14495 311 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 SLC37A1P57057 533 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf50Q5SZB4 431 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 MKRN2OSH3BPM6 223 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 MYF5P13349 255 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 OR1C1Q15619 314 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA46Q5T0L3 261 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS54Q6PEW0 395 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM9BQ9NQ34 198 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CLCF1Q9UBD9 225 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 WSB1Q9Y6I7 421 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 DRD3P35462 400 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 PLAC9Q5JTB6 97 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 FAHD2AQ96GK7 314 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 PDCD6O75340 191 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 KRASP01116 189 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 MPGP29372 298 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 OGG1O15527 345 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CTLA4P16410 223 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 LIMK1P53667 647 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 PRDX4Q13162 271 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 FAM122AQ96E09 287 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CDC14BO60729 498 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 RAB32Q13637 225 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A30Q5SVS4 291 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 DOCK2Q92608 1830 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 COL18A1P39060 1754 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF1AP19438 455 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 HYAL1Q12794 435 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 IGFBP7Q16270 282 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf78Q8N4C9 275 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 KLHDC1Q8N7A1 406 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 GNRHR2Q96P88 292 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 TAAR3PQ9P1P4 343 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF835Q9Y2P0 537 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 DBX1A6NMT0 343 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CALCRP30988 508 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1CBP62140 327 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB109BQ30KR1 87 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 UBAC2Q8NBM4 344 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 NAA60Q9H7X0 242 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CCL27Q9Y4X3 112 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 NGFP01138 241 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 IL13RA2Q14627 380 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.2 ms