RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 PMS2CLQ68D20 193 aa15.21■□□□□ 0.03
TRPC1-201ENST00000273482 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM123Q8N131 208 aa15.21■□□□□ 0.03
TRPC1-201ENST00000273482 D2HGDHQ8N465 521 aa15.21■□□□□ 0.03
TRPC1-201ENST00000273482 FAHD2AQ96GK7 314 aa15.21■□□□□ 0.03
TRPC1-201ENST00000273482 TLNRD1Q9H1K6 362 aa15.21■□□□□ 0.03
TRPC1-201ENST00000273482 PILRAQ9UKJ1 303 aa15.21■□□□□ 0.03
TRPC1-201ENST00000273482 ICAM5Q9UMF0 924 aa15.21■□□□□ 0.03
TRPC1-201ENST00000273482 MPZL1O95297 269 aa15.21■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 THY1P04216 161 aa15.21■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SLC25A4P12235 298 aa15.21■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ISXQ2M1V0 245 aa15.21■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 AWAT1Q58HT5 328 aa15.21■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 WDR5BQ86VZ2 330 aa15.21■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.21■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OR10D4PQ8NGN7 298 aa15.21■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa15.21■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PPH5 198 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PR64 198 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PRV1 198 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OR2M5A3KFT3 312 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CYB5BO43169 146 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 NAT2P11245 290 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ADIRFQ15847 76 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 NCMAPQ5T1S8 102 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 C1QL3Q5VWW1 255 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MOB1AQ9H8S9 216 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 POLEQ07864 2286 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 RAB27BO00194 218 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GGTLC2Q14390 218 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DNAJB11Q9UBS4 358 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SCGB1D1O95968 90 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 NPBWR1P48145 328 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 COMMD1Q8N668 190 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 C19orf12Q9NSK7 152 aa15.2■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GAS1P54826 345 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 C9orf152Q5JTZ5 239 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SLC16A14Q7RTX9 510 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GJC3Q8NFK1 279 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ASB5Q8WWX0 329 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 C11orf40Q8WZ69 217 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GNG13Q9P2W3 67 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 C7orf77A4D0Y5 90 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 KLF4O43474 513 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FAM157BP0CG42 384 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ADRA2CP18825 462 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GRB2P62993 217 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZXDAP98168 799 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 IL11RAQ14626 422 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OR2T2Q6IF00 324 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD37Q7Z713 158 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 NRIP2Q9BQI9 281 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 VSIG4Q9Y279 399 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 NPTNQ9Y639 398 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 AP4M1O00189 453 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 HSPB6O14558 160 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PHOX2AO14813 284 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CLEC18BQ6UXF7 455 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF485Q8NCK3 441 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DEFB124Q8NES8 71 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FBXO17Q96EF6 278 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FIGNL2A6NMB9 653 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CYTIPO60759 359 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TESK1Q15569 626 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TM4SF19Q96DZ7 209 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GPR173Q9NS66 373 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SLC39A9Q9NUM3 307 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 AMDHD2Q9Y303 409 aa15.19■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CEBPZOSA8MTT3 80 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM33P57088 247 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 P4HTMQ9NXG6 502 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MYOTQ9UBF9 498 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CUL9Q8IWT3 2517 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 QDPRP09417 244 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 HTR5AP47898 357 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SHEQ5VZ18 495 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM268Q5VZI3 342 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SGK3Q96BR1 496 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SLC35B3Q9H1N7 401 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 KCNE5Q9UJ90 142 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CT45A8P0DMV1 189 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CT45A9P0DMV2 189 aa15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms