RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 GLCCI1Q86VQ1 547 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 SGCDQ92629 289 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 FGGYQ96C11 551 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 C10orf35Q96D05 121 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 CHST5Q9GZS9 411 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 WDR13Q9H1Z4 485 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 BABAM2Q9NXR7 383 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-18Q9QC07 812 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 CTSZQ9UBR2 303 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 HHLA2Q9UM44 414 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 TRAV20A0A0B4J274 112 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC2LH3BP13 241 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 SLC1A7O00341 560 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 OGG1O15527 345 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 AMY2BP19961 511 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 PAX2Q02962 417 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 OR52N1Q8NH53 320 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 GATAD2BQ8WXI9 593 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 MMP26Q9NRE1 261 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 JMJD1CQ15652 2540 aa18.58■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 AKR7A2O43488 359 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 AVPP01185 164 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 GYPAP02724 150 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 RPS2P15880 293 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ZNF12P17014 697 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 MYL12AP19105 171 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 CDK5R1Q15078 307 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 CCDC58Q4VC31 144 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 IL17RELQ6ZVW7 336 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 CALHM1Q8IU99 346 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ZNF676Q8N7Q3 588 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 OR5AK2Q8NH90 309 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 TMEM212A6NML5 194 aa18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 SYNGR1O43759 233 aa18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 FOXH1O75593 365 aa18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 CCDC159P0C7I6 412 aa18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 UTS2BQ765I0 119 aa18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 PP6455Q8WZ26 134 aa18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHA1Q9HB21 404 aa18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 LRCH1Q9Y2L9 728 aa18.56■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 MPZP25189 248 aa18.55■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 VHLP40337 213 aa18.55■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 HAAOP46952 286 aa18.55■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 CRIP3Q6Q6R5 217 aa18.55■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ANGPTL5Q86XS5 388 aa18.55■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 STX19Q8N4C7 294 aa18.55■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 NANOGP1Q8N7R0 232 aa18.55■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 NPRL2Q8WTW4 380 aa18.55■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 KAAG1Q9UBP8 84 aa18.55■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa18.55■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GW55 424 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 NDUFA2O43678 99 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 CDK1P06493 297 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DUX4L2P0CJ85 424 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DUX4L3P0CJ86 424 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DUX4L4P0CJ87 422 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DUX4L5P0CJ88 424 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DUX4L6P0CJ89 424 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DUX4L7P0CJ90 424 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 HSPA13P48723 471 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 PITPNBP48739 271 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 FUT6P51993 359 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 GMFBP60983 142 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 SLC35A2P78381 396 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 MICBQ29980 383 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 CHRFAM7AQ494W8 412 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ESCO2Q56NI9 601 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 RNLSQ5VYX0 342 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ASPHD2Q6ICH7 369 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 RNF144BQ7Z419 303 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ZNF573Q86YE8 665 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 OR5T2Q8NGG2 359 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 OR8B3Q8NGG8 313 aa18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms