RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 FAM220AQ7Z4H9 259 aa17.99■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 GATAD2BQ8WXI9 593 aa17.99■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 EME1Q96AY2 570 aa17.99■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 TMIGD2Q96BF3 282 aa17.99■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 MED30Q96HR3 178 aa17.99■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 CNTD2Q9H8S5 307 aa17.99■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 PLEKHA1Q9HB21 404 aa17.99■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 NLKQ9UBE8 527 aa17.99■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 DUX4Q9UBX2 424 aa17.99■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 METTL15A6NJ78 407 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 RHBDL1O75783 438 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 ALPLP05186 524 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 HKR1P10072 659 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 GABRA2P47869 451 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 ODF4Q2M2E3 257 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 TUSC1Q2TAM9 212 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 KRT74Q7RTS7 529 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 SSX6Q7RTT6 188 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 CMTM4Q8IZR5 234 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 TBX15Q96SF7 602 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 ZNF696Q9H7X3 374 aa17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 40.5
NME4-201ENST00000219479 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 A0A1B0GVI7 797 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 OR2AT4A6NND4 320 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 H3BNX3 289 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 MMP9P14780 707 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 ALDH3A2P51648 485 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 FOXL1Q12952 345 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 CDONQ4KMG0 1287 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 SHISA2Q6UWI4 295 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 ZNF573Q86YE8 665 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 FGFRL1Q8N441 504 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 AQP3Q92482 292 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 LHX4Q969G2 390 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 ADI1Q9BV57 179 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 GPR173Q9NS66 373 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 USE1Q9NZ43 259 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 SLC22A13Q9Y226 551 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 KPTNQ9Y664 436 aa17.97■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 CLDN34H7C241 214 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 DLGAP1O14490 977 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 FCN3O75636 299 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 SULT1C4O75897 302 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 NDUFB7P17568 137 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 HAAOP46952 286 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 TGM4P49221 684 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 SLC9A3R2Q15599 337 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 DEFB112Q30KQ8 113 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 CBR4Q8N4T8 237 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 ANGPTL6Q8NI99 470 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 SIRPDQ9H106 197 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 GNG8Q9UK08 70 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 V9GYS6 101 aa17.96■□□□□ 0.47
NME4-201ENST00000219479 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 A6NIN4 97 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 SNTNA6NMZ2 147 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 DHRS7CA6NNS2 312 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 SYT7O43581 403 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 SELLP14151 372 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 SMIM21Q3B7S5 101 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 ZNF788Q6ZQV5 615 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 VMO1Q7Z5L0 202 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 OR14K1Q8NGZ2 314 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 HRASLS5Q96KN8 279 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 GAFA1Q96PS6 74 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 DCTN5Q9BTE1 182 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 NOX4Q9NPH5 578 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 RASL12Q9NYN1 266 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa17.95■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 A0A1B0GTI1 187 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 A0A1W2PQ09 198 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 SIGLEC5O15389 551 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 ENTPD6O75354 484 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 IGHV1-69P01742 117 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 TFF1P04155 84 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 CAPZA1P52907 286 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 ACTC1P68032 377 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 ACTA1P68133 377 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 MEDAGQ5VYS4 303 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 CATSPERDQ86XM0 798 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 PDZD9Q8IXQ8 264 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 TMEM185AQ8NFB2 350 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 C9orf16Q9BUW7 83 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 TNFRSF19Q9NS68 423 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 ACOXLQ9NUZ1 547 aa17.94■□□□□ 0.46
NME4-201ENST00000219479 SLC7A11Q9UPY5 501 aa17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms