RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028769.12

Ptpra-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpra, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpra-201ENSMUST00000028769 P01637 128 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 P01864 335 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Hist1h1cP15864 212 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 BidP70444 195 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Polr1dP97304 133 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm10644Q3TZG3 87 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm10662Q3UT86 313 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lyg2Q3V1I0 213 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp790Q80ZX2 779 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Esco2Q8CIB9 592 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Med25Q8VCB2 745 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr410Q8VFX7 315 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr402Q8VFX8 315 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr992Q8VGC6 309 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1044Q8VGR9 314 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 PpifQ99KR7 206 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Phospho2Q9D9M5 241 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ca14Q9WVT6 337 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Trav12-2A0N8N6 114 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 BC051665E9Q623 330 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fbxw25F7C9P2 466 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Igkv7-33P01632 114 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp11P10751 647 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp36l3Q5ISE2 725 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ptpmt1Q66GT5 193 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Srsf4Q8VE97 489 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1132Q8VG97 308 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tmem123Q91Z22 195 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Steap4Q923B6 470 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rnf138Q9CQE0 245 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tmem41aQ9D8U2 264 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bbip1J3QMK2 67 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Hoxa10P31310 416 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 AgrpP56473 131 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc17a1Q61983 465 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pon3Q62087 354 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fbxo22Q78JE5 402 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Il17fQ7TNI7 161 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 C8gQ8VCG4 202 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfand2bQ91X58 257 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rtn4rQ99PI8 473 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Stpg4Q9DAG5 247 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Clec6aQ9JKF4 209 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Anxa10Q9QZ10 324 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm6890A2BG94 208 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Scml2B1AVB3 969 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr199F6ZUS0 308 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp1P08042 402 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MatkP41242 505 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Galk2Q68FH4 458 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sat2Q6P8J2 170 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 SheQ8BSD5 492 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Swsap1Q8VCI7 278 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dyrk3Q922Y0 586 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mrps24Q9CQV5 167 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Stard10Q9JMD3 291 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r5B2RQT2 315 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Hspb1P14602 209 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Id1P20067 168 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 HgsnatQ3UDW8 656 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp954Q7TNU5 416 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Q80X32 188 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gpr89aQ8BS95 455 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sdhaf4Q8BTE0 104 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Acp7Q8BX37 438 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tmem150bQ8R218 238 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp959Q91VM8 539 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dnajc24Q91ZF0 196 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Emc3Q99KI3 261 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Atp5sQ9CRA7 200 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bex3Q9WTZ9 124 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Unc119Q9Z2R6 240 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Scgb1b30A2BH64 92 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ccl20O89093 97 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Klhl8P59280 629 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Crabp1P62965 137 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Wbp1P97764 304 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tie1Q06806 1134 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tmprss7Q8BIK6 829 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Calhm2Q8VEC4 323 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r43Q8VIC9 329 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Il24Q925S4 181 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MtfmtQ9D799 386 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rrp8Q9DB85 457 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 PaplnQ9EPX2 1280 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm13723A0A1L1SUP2 315 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ankrd60A2AMD2 318 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr747E9PXH6 313 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr31E9Q3K2 317 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr749E9Q438 313 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 CfdP03953 259 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zp3P10761 424 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dok1P97465 482 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mc2rQ64326 296 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nol4lQ6DIB4 494 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 AtraidQ6PGD0 223 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fam57bQ7TNV1 275 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1014Q7TR95 305 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1013Q7TR96 305 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lrfn4Q80XU8 636 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.7 ms