RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, human

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRVP-205	ENST00000641549	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	FFAR1	O14842	300 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	PCMT1	P22061	227 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	ANGPTL7	O43827	346 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	TGM1	P22735	817 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	DTYMK	P23919	212 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	KCNJ3	P48549	501 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	TAS2R45	P59539	299 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	OGG1	O15527	345 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	NDUFB3	O43676	98 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	NXPH3	O95157	252 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	MT-ND4L	P03901	98 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	PDGFA	P04085	211 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	NGFR	P08138	427 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	LINC00303	Q3SY05	128 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	SPRED2	Q7Z698	418 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	NRTN	Q99748	197 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	IGHA1	P01876	353 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	GZMK	P49863	264 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	GAB4	Q2WGN9	574 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	NDUFB6	O95139	128 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	FCAR	P24071	287 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	GZMM	P51124	257 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	RAB5C	P51148	216 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	PRDX4	Q13162	271 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZFP82	Q8N141	532 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF17	P17021	662 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	ACKR3	P25106	362 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	STARD6	P59095	220 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	MICB	Q29980	383 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF75A	Q96N20	296 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	OCEL1	Q9H607	264 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	PARP14	Q460N5	1801 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	TESK1	Q15569	626 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	CST2	P09228	141 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	PI3	P19957	117 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	GLI4	P10075	376 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	MEST	Q5EB52	335 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	OR2T2	Q6IF00	324 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	SLC39A7	Q92504	469 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	AK3	Q9UIJ7	227 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	SSSCA1	O60232	199 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	BAP18	Q8IXM2	172 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRVP-205	ENST00000641549	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
PTPRVP-205	ENST00000641549	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
PTPRVP-205	ENST00000641549	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		11.96	□□□□□ -0.5
PTPRVP-205	ENST00000641549	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
PTPRVP-205	ENST00000641549	CACNA1C	Q13936	2221 aa		11.96	□□□□□ -0.5
PTPRVP-205	ENST00000641549	SPRY3	O43610	288 aa		11.96	□□□□□ -0.5
PTPRVP-205	ENST00000641549	PDCD6	O75340	191 aa		11.96	□□□□□ -0.5
PTPRVP-205	ENST00000641549	CTAG2	O75638	210 aa		11.96	□□□□□ -0.5
PTPRVP-205	ENST00000641549	GABRA4	P48169	554 aa		11.96	□□□□□ -0.5
PTPRVP-205	ENST00000641549	MESP2	Q0VG99	397 aa		11.96	□□□□□ -0.5
PTPRVP-205	ENST00000641549	BAMBI	Q13145	260 aa		11.96	□□□□□ -0.5

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