RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 HSD11B1P28845 292 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 CX3CR1P49238 355 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 RAB13P51153 203 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 FXYD6P3P58550 94 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 BLCAPP62952 87 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 FAM3AP98173 230 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 IL18R1Q13478 541 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 DGCR6Q14129 220 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 COQ5Q5HYK3 327 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF626Q68DY1 528 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 CALHM1Q8IU99 346 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 OR2T4Q8NH00 348 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 OR4K13Q8NH42 304 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 TFAP2CQ92754 450 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 SDSLQ96GA7 329 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 IFT27Q9BW83 186 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 C1orf21Q9H246 121 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 FN3KQ9H479 309 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF222Q9UK12 451 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.92□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 NUDT19A8MXV4 375 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 IDH3BO43837 385 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 TFF1P04155 84 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 SPARCP09486 303 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 PGA5P0DJD9 388 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 PSG2P11465 335 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 ANOS1P23352 680 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 CHATP28329 748 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 OMPP47874 163 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 THBS3P49746 956 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 GSK3AP49840 483 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 SLC34A1Q06495 639 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 PRDX4Q13162 271 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 Q6ZS46 218 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF561Q8N587 486 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 OR10A2Q9H208 303 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 OR52D1Q9H346 318 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 CD300AQ9UGN4 299 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.91□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 OR6C68A6NDL8 312 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 MRASO14807 208 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 RHBDL1O75783 438 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 CCL3L1P16619 93 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 ENTPD1P49961 510 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 GNG3P63215 75 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 MAPRE2Q15555 327 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 LCN8Q6JVE9 175 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 OSR2Q8N2R0 312 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 NDNFQ8TB73 568 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 RNF170Q96K19 258 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 RCHY1Q96PM5 261 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 CENPMQ9NSP4 180 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 GID8Q9NWU2 228 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 RASL12Q9NYN1 266 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HLA-B-257ENST00000640094 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.9□□□□□ -1.31
HLA-B-257ENST00000640094 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.89□□□□□ -1.31
HLA-B-257ENST00000640094 PSMB11A5LHX3 300 aa6.89□□□□□ -1.31
HLA-B-257ENST00000640094 OR5B21A6NL26 309 aa6.89□□□□□ -1.31
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.89□□□□□ -1.31
HLA-B-257ENST00000640094 M0QZK8 103 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms