RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 GATSQ8NAP1 163 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF681Q96N22 645 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 Q9N2J8 555 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SIAH2O43255 324 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 DIRAS3O95661 229 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SCGB1D1O95968 90 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 TACSTD2P09758 323 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 COL9A1P20849 921 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 THBS4P35443 961 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 WNT5AP41221 380 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 EMDP50402 254 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35A1P78382 337 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 PAX5Q02548 391 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 EGR3Q06889 387 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 P2RY6Q15077 328 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ZIC1Q15915 447 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 VHLLQ6RSH7 139 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF429Q86V71 674 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 NEK7Q8TDX7 302 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SMARCD2Q92925 531 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 GAB2Q9UQC2 676 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ZZEF1O43149 2961 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 B3GALT2O43825 422 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF205O95201 554 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 KAT7O95251 611 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 PNPP00491 289 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 OR3A1P47881 315 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 DCAF7P61962 342 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 DCST2Q5T1A1 773 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM156Q8N614 296 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 TERB2Q8NHR7 220 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 R3HDM4Q96D70 268 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 NUDT9Q9BW91 350 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 IL23AQ9NPF7 189 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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PTPRT-211ENST00000618610 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRT-211ENST00000618610 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 CEACAM6P40199 344 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 MMP16P51512 607 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 PMS2P11Q13670 270 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 RNF144BQ7Z419 303 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 YAF2Q8IY57 180 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 COMMD1Q8N668 190 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 OR4K15Q8NH41 348 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 REEP6Q96HR9 211 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 LUZP4Q9P127 313 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 B9D1Q9UPM9 204 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 A0A087WUJ7 227 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 ABHD16AO95870 558 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 AGR2O95994 175 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 CEACAM5P06731 702 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 ALOX5APP20292 161 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A1P53007 311 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 RUNX2Q13950 521 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 AGBL4Q5VU57 503 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM225Q6GV28 225 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF774Q6NX45 483 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZVH6 145 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 VN1R4Q7Z5H5 301 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 POC1AQ8NBT0 407 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 NICN1Q9BSH3 213 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 HDAC8Q9BY41 377 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 FGF22Q9HCT0 170 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-211ENST00000618610 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.26□□□□□ -1.25
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