RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CPLX4Q7Z7G2 160 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 IQCF1Q8N6M8 205 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 OTOSQ8NHW6 89 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 PIGCQ92535 297 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 LYZL4Q96KX0 146 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 NLKQ9UBE8 527 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 OR2AT4A6NND4 320 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 LYNP07948 512 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 POU1F1P28069 291 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 BLMHQ13867 455 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 HCP5Q6MZN7 132 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R35Q8TAP8 253 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 TEX47Q8TBZ9 253 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 OR51V1Q9H2C8 321 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 H3BUX3 64 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 THEM6Q8WUY1 208 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf50Q8WW18 174 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 AJUBAQ96IF1 538 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 SSX3Q99909 188 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 RHBDL1O75783 438 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 PAICSP22234 425 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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PTPRF-216ENST00000617451 GPM6AP51674 278 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 HERPUD1Q15011 391 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZTK2 550 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 KRT74Q7RTS7 529 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 OR8B12Q8NGG6 310 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 OR5D13Q8NGL4 314 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF222Q9UK12 451 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 SIGLEC9Q9Y336 463 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 MAB21L2Q9Y586 359 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 H3BN98 237 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 SELENOFO60613 162 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 PSG2P11465 335 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 KIR2DS4P43632 304 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 EFNB2P52799 333 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 LCN8Q6JVE9 175 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 ZNRF1Q8ND25 227 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 FEVQ99581 238 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 FAM234AQ9H0X4 552 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 OR51I2Q9H344 312 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 H0YAE9 185 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 PLBD1Q6P4A8 553 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf88Q6PI97 169 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRF-216ENST00000617451 OR51G2Q8NGK0 314 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRF-216ENST00000617451 MEGF9Q9H1U4 602 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 MUC13Q9H3R2 512 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 NIPAL2Q9H841 368 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRF-216ENST00000617451 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 OPN1MW2P0DN77 364 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 OPN1MW3P0DN78 364 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 MNAT1P51948 309 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 GNG3P63215 75 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 GK3PQ14409 553 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 LY6EQ16553 131 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 BEAN1Q3B7T3 259 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 CRIP3Q6Q6R5 217 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM185AQ8NFB2 350 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 SDSLQ96GA7 329 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF732B4DXR9 585 aa20.28■□□□□ 0.84
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PTPRF-216ENST00000617451 MS4A2Q01362 244 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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PTPRF-216ENST00000617451 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 CEACAM21Q3KPI0 293 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 FAM185AQ8N0U4 392 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 OR4C13Q8NGP0 309 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF671Q8TAW3 534 aa20.28■□□□□ 0.84
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PTPRF-216ENST00000617451 GIPC3Q8TF64 312 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 CFHR4Q92496 578 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 FOXJ3Q9UPW0 622 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 LRP12Q9Y561 859 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 ARRDC5A6NEK1 342 aa20.27■□□□□ 0.84
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