RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 AKR7A2O43488 359 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 NID1P14543 1247 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ZXDAP98168 799 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 KLRB1Q12918 225 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC25A26Q70HW3 274 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 CD3DP04234 171 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 EXD3Q8N9H8 876 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ELOVL1Q9BW60 279 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 PBOV1Q9GZY1 135 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FZR1Q9UM11 496 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 C4AP0C0L4 1744 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 C4BP0C0L5 1744 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 MYLKQ15746 1914 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PNR3 127 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 HRO43593 1189 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 CEACAM6P40199 344 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 LIM2P55344 173 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ASAH1Q13510 395 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 GALNT16Q8N428 558 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 JAM3Q9BX67 310 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 USP3Q9Y6I4 520 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 DUSP5Q16690 384 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ATOH8Q96SQ7 321 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 CNTD2Q9H8S5 307 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 HRASP01112 189 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 VMA21Q3ZAQ7 101 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 NUP37Q8NFH4 326 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 GRAMD2BQ96HH9 432 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SERPINE3A8MV23 424 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 UBE2L6O14933 153 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 HOXC13P31276 330 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 DMRTC1Q5HYR2 192 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FAHD2AQ96GK7 314 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 MARCH5Q9NX47 278 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF391Q9UJN7 358 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 PPIHO43447 177 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 MS4A8Q9BY19 250 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SNRPGP15A8MWD9 76 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF519Q8TB69 540 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1B0GTW7 788 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 OR5B21A6NL26 309 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SPRED1Q7Z699 444 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC48A1Q6P1K1 146 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 MRAP2Q96G30 205 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 NPAS1Q99742 590 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 NAA60Q9H7X0 242 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 R4GMQ9 66 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 LYZP61626 148 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 GABRA6Q16445 453 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FCRL6Q6DN72 434 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF841Q6ZN19 808 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC16A11Q8NCK7 471 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 OR5R1Q8NH85 324 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 CLDN20P56880 219 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 RSRP1Q9BUV0 290 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 LHX3Q9UBR4 397 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 MFNGO00587 321 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 NDUFB3O43676 98 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FGF2P09038 288 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 OLIG3Q7RTU3 272 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SMIM19Q96E16 107 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SNED1Q8TER0 1413 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 CTSLP07711 333 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ZP3P21754 424 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 PDPNQ86YL7 162 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 MRC1P22897 1456 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1B0GUH1 482 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 M0QZQ0 153 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR61Q9BZJ8 451 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF77Q15935 545 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 D2HGDHQ8N465 521 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM210BQ96KR6 192 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 LAMB1P07942 1786 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 S1PR5Q9H228 398 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TCTAP57738 103 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ASB13Q8WXK3 278 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms