RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		F5H5K5	113 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		F8VVB4	439 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		F8VWA3	439 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SPINT1	O43278	529 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	LYPD3	O95274	346 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CDS2	O95674	445 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	LCAT	P04180	440 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	FGF7	P21781	194 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	METAP1	P53582	386 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MIDN	Q504T8	468 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MKX	Q8IYA7	352 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ASB10	Q8WXI3	467 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SHD	Q96IW2	340 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SPSB2	Q99619	263 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PLK3	Q9H4B4	646 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	NAA60	Q9H7X0	242 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GPR84	Q9NQS5	396 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GPR132	Q9UNW8	380 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		3.15	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	RNF222	A6NCQ9	220 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	POM121B	A6NF01	834 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM74A7	A6NL05	159 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		H3BML4	177 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	EREG	O14944	169 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	EFS	O43281	561 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	IGHE	P01854	428 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PF4	P02776	101 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CYC1	P08574	325 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CT45A8	P0DMV1	189 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CT45A9	P0DMV2	189 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RAB4A	P20338	218 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CD38	P28907	300 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PSMB3	P49720	205 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C1orf61	Q13536	156 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR8G1	Q15617	311 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FBXL17	Q9UF56	701 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	KLK13	Q9UKR3	277 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	LINC01553	A4QN01	128 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF724	A8MTY0	619 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	STMND1	H3BQB6	276 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CLDN34	H7C241	214 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NDUFS8	O00217	210 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	XRCC2	O43543	280 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NME2P1	O60361	137 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DHRS3	O75911	302 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SYNGR4	O95473	234 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OPN1MW	P04001	364 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GLA	P06280	429 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CD79A	P11912	226 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SELL	P14151	372 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PTGFR	P43088	359 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	EFNB2	P52799	333 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CLDN15	P56746	228 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PIGP	P57054	158 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RAB31	Q13636	194 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ERV3-1	Q14264	604 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91

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