RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TECTBQ96PL2 329 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TMED9Q9BVK6 235 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PIGLQ9Y2B2 252 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1B0GWJ7 208 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 M0R233 179 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF20P17024 532 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ACKR3P25106 362 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 OR13G1Q8NGZ3 307 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 OR10AC1Q8NH08 325 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 DIRC2Q96SL1 478 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC30A2Q9BRI3 323 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SOX7Q9BT81 388 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 MPC1Q9Y5U8 109 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF879B4DU55 563 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SC5DO75845 299 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 GNALP38405 381 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 MMP15P51511 669 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS25P62851 125 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 MST1LQ2TV78 715 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CLVS2Q5SYC1 327 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM42Q69YG0 159 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 UTS2BQ765I0 119 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PARP16Q8N5Y8 322 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 OR51A4Q8NGJ6 313 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 OR13F1Q8NGS4 319 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 C10orf105Q8TEF2 133 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CACNG6Q9BXT2 260 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 MS4A5Q9H3V2 200 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM100Q9NV29 134 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ADH4P08319 380 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CD36P16671 472 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PPOXP50336 477 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 MZT1Q08AG7 82 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ACSM3Q53FZ2 586 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM255AQ5JRV8 349 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 C11orf71Q6IPW1 123 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPINA12Q8IW75 414 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 OR5AS1Q8N127 324 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SPERTQ8NA61 448 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM106AQ96A25 262 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CHST5Q9GZS9 411 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 NEK6Q9HC98 313 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 DYNLRB1Q9NP97 96 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 STUB1Q9UNE7 303 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-214ENST00000592483 ALX3O95076 343 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 FAHP16930 419 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 TGFBR2P37173 567 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PRSS12P56730 875 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ALKBH6Q3KRA9 238 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR141Q7Z602 305 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 BHLHE23Q8NDY6 225 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 OR5D14Q8NGL3 314 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 OR13C5Q8NGS8 318 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 FGGYQ96C11 551 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 YIPF6Q96EC8 236 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CKLFQ9UBR5 152 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD61A6NGH8 418 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ARL6IP5O75915 188 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CSF3P09919 207 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 FSTP19883 344 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 SOX2P48431 317 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF81P51508 661 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PCGF3Q3KNV8 242 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 UBASH3BQ8TF42 649 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM203Q969S6 136 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 DERL3Q96Q80 235 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 OR14A2Q96R54 314 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 SSR3Q9UNL2 185 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 H3BSH0 61 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 GABRPO00591 440 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 GPX5O75715 221 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 NRASP01111 189 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFSF4P23510 183 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PRDX4Q13162 271 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM209AQ5JX71 171 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CEACAM19Q7Z692 300 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PIGCQ92535 297 aa19.99■□□□□ 0.79
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