RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591107.6

NPC1-212, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 3

Gene NPC1, Length 890 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-212	ENST00000591107	SSX6	Q7RTT6	188 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	OR2T27	Q8NH04	317 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM165	Q9HC07	324 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	TG	P01266	2768 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	C22orf46	C9J442	243 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	PLAT	P00750	562 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	KCNMB1	Q16558	191 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	MIDN	Q504T8	468 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	RNLS	Q5VYX0	342 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	OTOS	Q8NHW6	89 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	SLC25A28	Q96A46	364 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	UPRT	Q96BW1	309 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	MNT	Q99583	582 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF649	Q9BS31	505 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	ALG8	Q9BVK2	526 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	MND1	Q9BWT6	205 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NPC1-212	ENST00000591107	SFTPB	P07988	381 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	RAC2	P15153	192 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	ALOX5AP	P20292	161 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	PITPNB	P48739	271 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	FGF12	P61328	243 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	BLMH	Q13867	455 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	GALE	Q14376	348 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	TEX30	Q5JUR7	227 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	OR8G5	Q8NG78	346 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	THEM6	Q8WUY1	208 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	OR5M11	Q96RB7	305 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	AMELY	Q99218	206 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	C5orf63	A6NC05	138 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	PRR32	B1ATL7	298 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	PHYH	O14832	338 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	TFAP2A	P05549	437 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	WNT4	P56705	351 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	IL13RA1	P78552	427 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	DOC2B	Q14184	412 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	MED22	Q15528	200 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	MPPED2	Q15777	294 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	PCK2	Q16822	640 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF404	Q494X3	552 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	TP53I3	Q53FA7	332 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	NAA40	Q86UY6	237 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	OR52N1	Q8NH53	320 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	FCGR1B	Q92637	280 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	RORB	Q92753	470 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	MUL1	Q969V5	352 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	OR8B2	Q96RD0	313 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	ABHD6	Q9BV23	337 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
NPC1-212	ENST00000591107	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		11.01	□□□□□ -0.65

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