RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584997.1

CASC3-210, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

TSL 3

Gene CASC3, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-210ENST00000584997 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 PNKDQ8N490 385 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 GIPC3Q8TF64 312 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 AASSQ9UDR5 926 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 A0A1W2PQ09 198 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 TVP23AA6NH52 213 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 H3BUX3 64 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 M0R129 80 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 TBX1O43435 398 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 IDH3BO43837 385 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 GADD45GO95257 159 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 PYCR1P32322 319 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 CSNK2BP67870 215 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 ACSM1Q08AH1 577 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 MED21Q13503 144 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 MICAQ29983 383 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 NCR3LG1Q68D85 454 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 C11orf88Q6PI97 169 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 WDR82Q6UXN9 313 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SGCDQ92629 289 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SEH1LQ96EE3 360 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 NRBF2Q96F24 287 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 FEVQ99581 238 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 VCXQ9H320 206 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 C8orf4Q9NR00 106 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 CENPMQ9NSP4 180 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 CDIPTO14735 213 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 XPNPEP2O43895 674 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 CCNB2O95067 398 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 GASTP01350 101 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SPARCP09486 303 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SELLP14151 372 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 GNALP38405 381 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 UBE2E1P51965 193 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 EFNB2P52799 333 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SMIM11AP58511 58 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 GMFBP60983 142 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 APOFQ13790 326 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 BLMHQ13867 455 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 LY6EQ16553 131 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 TIGD6Q17RP2 521 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SLC16A9Q7RTY1 509 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 WDR86Q86TI4 376 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 C11orf53Q8IXP5 236 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 Q8N7P7 452 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 BEND2Q8NDZ0 799 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 OR5T2Q8NGG2 359 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 OR2T4Q8NH00 348 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 TNFRSF14Q92956 283 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SPSB4Q96A44 273 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SLAMF6Q96DU3 332 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 KCNJ15Q99712 375 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SSX3Q99909 188 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 GABARAPL3Q9BY60 117 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 RAB18Q9NP72 206 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 ZNF878C9JN71 531 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 H0YAE9 185 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 M0R1W7 72 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 SLC16A6O15403 523 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 NDUFB7P17568 137 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 POU1F1P28069 291 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC3-210ENST00000584997 HSD11B1P28845 292 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms