RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	CD40LG	P29965	261 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LCN1	P31025	176 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SLC15A1	P46059	708 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CAPZA2	P47755	286 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	P2RX1	P51575	399 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGDIA	P52565	204 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CRISP1	P54107	249 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	FUT5	Q11128	374 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LTB4R	Q15722	352 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CD226	Q15762	336 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SSX1	Q16384	188 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SYPL1	Q16563	259 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	DGUOK	Q16854	277 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TIGD6	Q17RP2	521 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	C12orf73	Q69YU5	71 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	REEP3	Q6NUK4	255 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ADCK1	Q86TW2	530 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	DRAM1	Q8N682	238 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OR4C3	Q8NH37	302 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LGALS12	Q96DT0	336 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM19	Q96HH6	336 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TMED9	Q9BVK6	235 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	MFF	Q9GZY8	342 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	C1orf198	Q9H425	327 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772		Q9N2J8	555 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	POLE4	Q9NR33	117 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	INIP	Q9NRY2	104 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	NEB	P20929	6669 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772		A6NLC8	198 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772		M0R3H8	397 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	AIRE	O43918	545 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ENTPD6	O75354	484 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GPX5	O75715	221 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	UBL3	O95164	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF205	O95201	554 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GADD45G	O95257	159 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SOX14	O95416	240 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	IGKV1D-16	P01601	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	IGLV1-51	P01701	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SPARC	P09486	303 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PAX6	P26367	422 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	MPV17	P39210	176 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	HTR5A	P47898	357 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ALDH9A1	P49189	494 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	MAPK12	P53778	367 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	DLX1	P56177	255 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	RAB1A	P62820	205 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CSNK2B	P67870	215 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ST3GAL4	Q11206	333 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	HSPB3	Q12988	150 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CBX3	Q13185	183 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TP53BP2	Q13625	1128 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	KCNJ8	Q15842	424 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	RGS21	Q2M5E4	152 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CBLN3	Q6UW01	205 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF329	Q86UD4	541 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CADM3	Q8N126	398 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	STX19	Q8N4C7	294 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GATS	Q8NAP1	163 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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