RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563577.1

RABEP2-208, Transcript of rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 2, human

TSL 4

Gene RABEP2, Length 589 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABEP2-208	ENST00000563577	IGLV3-1	P01715	115 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	OSM	P13725	252 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	HCCS	P53701	268 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	MIDN	Q504T8	468 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	PNKD	Q8N490	385 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	PIGC	Q92535	297 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	RNF170	Q96K19	258 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	C1orf21	Q9H246	121 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	C16orf95	Q9H693	158 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	FAM206A	Q9NX38	181 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RABEP2-208	ENST00000563577	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	FBP1	P09467	338 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	CAV3	P56539	151 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	GUCA2A	Q02747	115 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	HCP5	Q6MZN7	132 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	AJUBA	Q96IF1	538 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	LRGUK	Q96M69	825 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	OR51I2	Q9H344	312 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	NIPAL2	Q9H841	368 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	NLK	Q9UBE8	527 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577		A0A0U1RQV5	110 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577		A0A1W2PRD5	423 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577		A0A1W2PRF3	423 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577		A0A1W2PRM7	423 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	CCDC182	A6NF36	153 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	AQP12B	A6NM10	295 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	OR2AT4	A6NND4	320 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577		M0R1W7	72 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	TSPAN9	O75954	239 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	FAM107A	O95990	144 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	PRKACG	P22612	351 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	SAA4	P35542	130 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	GPM6A	P51674	278 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	MED30	Q96HR3	178 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	MMP27	Q9H306	513 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	TG	P01266	2768 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577		M0QZ24	198 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	PSMD9	O00233	223 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	TIMM23	O14925	209 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	HMGN1	P05114	100 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	PSG2	P11465	335 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	UBE2E1	P51965	193 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	ROM1	Q03395	351 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	APOF	Q13790	326 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	CEP78	Q5JTW2	689 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	AQP3	Q92482	292 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	THTPA	Q9BU02	230 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	ACOD1	A6NK06	481 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	ZNF732	B4DXR9	585 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	GNGT2	O14610	69 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	TSPAN15	O95858	294 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	GLRA1	P23415	457 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	MAP2K3	P46734	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	GNG3	P63215	75 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	ACSM1	Q08AH1	577 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	KRT77	Q7Z794	578 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	C17orf50	Q8WW18	174 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	SDSL	Q96GA7	329 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	TEAD3	Q99594	435 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	COPS3	Q9UNS2	423 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RABEP2-208	ENST00000563577	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		12.79	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms